上海海洋大學海洋學院是在1912年上海海洋大學成立時所設捕撈科基礎上發展起來的傳統特色學院。設有海洋漁業系、漁業資源系、海洋環境系和海洋信息工程系，建有遠洋漁業研究所、海洋法律與政策研究所、漁業遙感與信息研究中心、中美海洋遙感及漁業信息研究中心、上海海洋生物資源與環境創新平台、農業部遠洋漁業培訓中心、全球海上搜救和安全系統（GMDSS）模擬等特色科研平台、實驗室和培訓設施，擁有中國漁業協會遠洋漁業分會魷釣技術組、金槍魚技術組、大型中層拖網等全國性技術諮詢和服務機構。
現有1個
農業部重點學科，1個
上海市教委重點建設學科，1個上海市教委
海洋生物資源與環境創新平台和1個上海市教育高地；有2個
博士點，3個碩士點，4個本科專業，其中海洋漁業科學與技術專業被列為國家管理專業，涉海類專業所屬捕撈學學科為上海市重點學科。
學院現有在職教工55名，教授14名，副教授10名。享有國家政府津貼4人，國務院學位委員會學科評議組成員1名，國家級有突出貢獻中青年專家1名，省部級有突出貢獻的中青年專家2名，農業部第七屆科技委成員2名，教育部本科教學指導委員會成員1名，
教育部新世紀優秀人才1人，上海市科委
啟明星1人，上海市教委曙光學者2人。
建校90餘年來，海洋學院為我國生產、教育、科研和管理部門培養和輸送了大批優秀高級的專業人才，許多校友已成為所在部門的領導和科研骨幹。特別是為
遠洋漁業的起步和發展提供了強有力的技術支撐。在廣大教職工的努力下，學院在教學、科研上取得了豐碩的成果。曾獲國家級教學成果一等、二等獎，上海市教學成果
特等獎、一等獎，國家級科技進步三等獎，農業部科技進步一等、二等獎，教育部科技進步二等獎，上海市科技進步二等獎，上海市產學研工程一等獎等獎項10多項。