轉錄間隔區

轉錄間隔區

內部轉錄間隔區（ITS），RNA（rRNA,ribosomalRNA）中存在於結構RNA的非功能性RNA序列，通常這段序列存在於轉錄前體RNA中（pre-RNA，precursor RNA）。

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1定義 2該區域的應用

定義

從5‘到3’方向，這個多順反子轉錄前體rRNA包含了外轉錄間隔區（5' external transcribed sequence ，簡稱5' ETS)18S rRNA, ITS1, 5.8S rRNA, ITS2, 28S rRNA 最後是3'ETS。

在rRNA成熟過程中，外轉錄間隔區和轉錄間隔區被切割，並且作為非功能成熟副產品很快被分解。編碼rRNA的基因與間隔區是數以千計的串聯重複序列，這些基因被非轉錄DNA（稱為基因間間隔區，或轉錄單元間隔區，intergenic spacers，IGS；或稱為非轉錄間隔區non-transcribed spacers,NTS）。

該區域的應用

ITS被廣泛用於分類學和分子系統學（molecular phylogeny），由於：

1）大量的拷貝，使得它容易擴增。

2）即使在相近的種群中也有著高度的變異。因為作為非功能片段，其有著很低的進化壓力。

例如：ITS被證明在辨明同屬的物種的關係中扮演重要的作用，在菊科植物的關係和臨床上重要的酵母類之間關係的闡明上有著重要作用。(Baldwin, 1992; Baldwin et al., 1995; Kim et al., 1996) as well as clinically important yeast species.）

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