首都機場出入境檢驗檢疫局隸屬於北京出入境檢驗檢疫局,是副廳(局)級分支機構。
內設辦公室、法制與綜合業務處、檢務處、快件檢驗檢疫處、貨物檢驗檢疫處、旅客檢疫處、航空器檢疫處、口岸衛生監督處、人事處、財務處、
機關黨委辦公室(政工處)和紀檢監察室。
主要負責
首都機場口岸出入境人員、旅客攜帶物、貨物、交通工具、運輸設備、包裝物的檢驗檢疫和監督管理以及核生化恐怖事件應對工作;負責首都機場口岸衛生許可及衛生監督、
傳染病監測工作;負責首都機場口岸出入境特殊物品衛生檢疫監督工作;負責首都機場口岸入境的食品、化妝品、植物產品、食用性動物產品、食用性水生動物、用於銷售的成品盆栽花卉、進口石材的檢驗檢疫監管工作。