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BSA

集團分離分析法

BSA法克服了很多作物難以得到近等基因系的限制,並且比近等基因系法省時省力,是一種非常實用的基因標記定位的方法,應用非常廣泛。

目錄

正文


生物信息學中用於QTL或基因定位的一類分析方法
BSA(分離體分組混合分析法或混合分組分析法,又稱 集團分離分析法,Bulked Segregant Analysis)分析法首次由Michlmore等…提出並成功地在萵苣中篩選出與目的基因相連鎖的標記。該方法首先從一對具有目標基因的表型差異的親本所產生的任何一種分離群體中,根據目標基因的表型分別選取一定數量的植株,構成 2個亞群或集團。將每群的 DNA等量混合,形成兩個相對性狀基因池”(gene pool),然後用合適的分子標記對兩個基因池進行分析,在兩群間表現多態性的分子標記遺傳上與目標性狀基因座位相連鎖。在獲得了與目標基因相連鎖的分子標記以後,可以利用某一作圖群體進行分析以便進一步檢測所得分子標記與目標性狀基因的連鎖程度,以及其在某已知分子圖譜中或染色體上的位置,這樣才能完成真正意義上的對基因的標記定位。由於建池時使用了特定的分離群體,並且在分組時僅對目標性狀進行選擇,這樣可以保證其他性狀的遺傳背景基本相同,兩個基因池之間理論上就應主要在目標基因區段存在差異,因此兩基因池又被稱為近等基因池,這就排除了環境及人為因素的影響,使研究結果更為準確可靠¨。
可與BSA相結合用於基因定位的分子標記有多種,常用的分子標記有 RFLP(限制性片段長度多態性,Restriction Fragment Length Polymorphism),RAPD(隨機擴增多態性 DNA,Random Amplified Polymorphism DNA),AFLP (擴增片段長度多態性,Amplified Fragment Length Polymorphism),SSR(簡單重複序列,Simple Sequence Repeats)SSR等。