車公廟站

車公廟站在車公廟路旁，共分為2層。是馬鞍山線其中一個架空車站。車站大堂位於地面，月台設於大堂之上。車站設有2個月台，採用側式月台方式排列，月台南面設有預留空間以便馬鞍山線延長至8卡行走。其中往大圍方向的月台近車尾位置，於2013年5月15日起設小型大堂通往E及F出口，方便溱岸8號住客出入之用。大堂與月台層之間設有升降機和扶手電筒梯，方便乘客使用。

車公廟站於2004年啟用時設有4個出入口，當中所有出入口分佈於車站大堂。在各個車站出入口，均設有指示牌顯示出入口周邊的建築物及設施列表。到2010年尾，月台層新增一條天橋連接溱岸8號為E出入口；F出入口則由月台層通往獅子山隧道公路。兩個新出入口於2013年5月15日溱岸8號入伙后啟用，其中E出口更是港鐵全線唯一一個連接住宅平台的入口，亦是唯一只供住客使用的出口。該出口設八達通讀卡器，住客需經登記八達通才可進出。

A -香港文化博物館

B - 車公廟

車公廟、秦石邨、信義會救恩堂、豐盛苑、李屋村、新田圍邨

C -城門河

城門河

設有斜道往返地面

D - 沙田頭

沙田頭、沙田公園、曾大屋遊樂場

設有斜道及失明人士引導徑往返地面

九巴

47X、80X、81C、81K、81M、82K、85B、86A、86C、87A、87B、249X、282

過海隧道巴士：

170、182

龍運巴士

E42

新界專線小巴：

68K

車公廟站在馬鞍山線通車（2004年12月21日）同日正式啟用，原來建議的站名為沙田頭站。由於來往東鐵線需轉車及此站對外的車資較東鐵線對外的高，有些往返大埔區或北區至此站周邊設施的人，會選擇步行20分鐘到沙田站或大圍站轉乘東鐵線往大埔區或北區。