藥物分子與蛋白質分子相互結合的主要部位是蛋白質上的鹼性氨基酸殘基,相互作用力主要有靜電作用、氫鍵、疏水作用、范德華力和電荷轉移作用,通常藥物與蛋白之間的相互作用並不是一種作用力的單獨作用,而是多種作用力的協同作用。這種相互作用的量化參數就是藥物與蛋白的結合常數Ka。
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