電泳緩衝液
用於穩定體系酸鹼度的緩衝溶液
電泳緩衝液是核酸、蛋白質凝膠電泳系統的一個重要組成,是電泳場中的導體,也是維持電泳系統恆定pH值的必要條件。其成分及其離子強度影響物質的電泳遷移率,應避免與被分離的樣品發生化學反應而改變樣品的理化性質或使其喪失生物活性。電泳緩衝液中的EDTA可螯合Mg離子等二價陽離子,防止電泳時激活DNA酶及Mg離子與核酸生成沉澱。
緩衝液在電泳過程中的一個作用是維持合適的pH。電泳時陽極與陰極都會發生電解反應,陽極發生的是氧化反應(4OH--4e->2H2O+O2),陰極發生的是還原反應(4H++4e->2H2),長時間的電泳將使陽極變酸,陰極變鹼。一個好的緩衝系統應有較強的緩衝能力,使溶液兩極的pH保持基本不變。
電泳緩衝液的另一個作用是使溶液具有一定的導電性,以利於DNA分子的遷移,例如,一般電泳緩衝液中應含有0.01-0.04mol/L的Na+離子,Na+離子的濃度太低時電泳速度變慢;太高時就會造成過大的電流使膠發熱甚至熔化。
TAE是使用最廣泛的緩衝系統。其特點是超螺旋在其中電泳時更符合實際相對分子質量(TBE中電泳時測出的相對分子質量會大於實際分子質量),且雙鏈線狀DNA在其中的遷移率較其他兩種緩衝液快約10%,電泳大於13kb的片段時用TAE緩衝液將取得更好的分離效果,此外,回收DNA片段時也易用TAE緩衝系統進行電泳。TAE的缺點是緩衝容量小,長時間電泳(如過夜)不可選用,除非有循環裝置使兩極的緩衝液得到交換。
TBE的特點是緩衝能力強,長時間電泳時可選用TBE,並且當用於電泳小於1kb的片段時分離效果更好。TBE用於瓊脂糖凝膠時易造成高電滲作用,並且因與瓊脂糖相互作用生成非共價結合的四羥基硼酸鹽複合物而使DNA片段的回收率降低,所以不宜在回收電泳中使用。
TPE的緩衝能力也較強,但由於磷酸鹽易在乙醇沉澱過程中析出,所以也不宜在回收DNA片段的電泳中使用。
50×TAE Buffer配製方法:
1。稱量氨基丁三醇242g,Na2EDTA.2H2O 37.2g於1L燒杯中;
2。向燒杯中加入約600ml去離子水,充分攪拌均勻;
3。加入57.1ml的冰乙酸,充分溶解;
4。用NaOH調pH至8.3,加去離子水定容至1L后,室溫保存。
使用時稀釋50倍即1×TAE Buffer
10×TBE Buffer配製方法:
1。稱量氨基丁三醇108g,Na2EDTA.2H2O 7.44g,硼酸55g於1L燒杯中;
2。加入約700ml去離子水,攪拌均勻;
3。用NaOH調pH至8.3,加去離子水定容至1L后,室溫保存。
使用時稀釋10倍即1×TBE Buffer