重複序列

重複序列

重複序列(repeated sequence): 基因序列的多拷貝。自然狀態下,重複序列並不發生失活現象,基因工程中轉基因失活與多拷貝有關,它可串聯排列在染色體同一位點,也可以分散在都能造成轉基因失活。可能是重複序列之間通過異位配對形成染色體構型的不同染色體位置,變化,使重複序列位點染色體發生收縮(是染色質化),從空間上阻礙了轉錄因子與轉基因的接觸,使基因處於關閉狀態。

真核生物的基因組相當於基因的一 般只有一個複製DNA序列(也稱單一DNA,unique sequence,single copy sequence,nonrepetitive sequence等)和具有多數反覆存在的DNA順序組成。

簡介


稱後者為重複順序。組成基因組的DNA順序,根據其重複的頻度可分為三類。一是基因組只有一個複製順序的單一DNA,二為高度重複順序(highly repetitivesequence),由較短的順序105—107次直線連結而成,其中含隨體DNA等。第三為中等程度的重複順序(moderately repetitive sequence),為有300—500個核苷對的大致相同的順序——例如在將哺乳類的DNA用限制酶AluI(AG↓CT)切斷時所產主的主要片斷中所見到的高頻率(105)的順序(AluIfamily)——與單一DNA一起分散存在的,以及像核糖體RNA基因或組蛋白基因群那樣的多次成直線相連存在的(多基因群)都包含在這一類中。此外有在反方向上重複的順序(inverted repetitive seq-uence),其變性DNA摺疊成髮夾結構(hairpinstructure,foldback structure,snapback stru-cture),在編碼分析中可迅速再結合的類型。
染色體上存在的大量無轉錄活性的重複DNA序列。其組織形式有兩種:串聯重複序列;分散重複序列。前一種成簇存在於染色體的特定區域,后一種分散於染色體的各位點上。

類型


高度重複序列

重複幾百到幾百萬次,一般是少於10個核苷酸殘基組成的短片段。如異染色質上的衛星DNA。它們是不翻譯的片段。在小鼠中約佔基因組的10%

中度重複序列

重複次數為十次到幾百次。在小鼠中約佔20%。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白質(如組蛋白、肌動蛋白、角蛋白等)的基因。
單拷貝序列
就是在整個基因組中獨有的一段序列,沒有與它相似的重複片段。它佔到哺乳動物核酸含量的50%~60%。
輕度重複序列
是指重複2~10次的一些序列,例如tRNA基因和一些組蛋白基因;