簡桂良主持和參加國家高863“棉花抗黃枯萎病
基因工程研究”，國家科技攻關：“普通
棉花育種材料研究-新技術、新方法研究”，“棉花病蟲害綜合防治關鍵技術”以及
農業部發展棉花生產專項資金項目、
聯合國UNIDO項目、
中國農科院西部開發項目、農業部“棉花抗病蟲性鑒定標準”等項目的研究。
1995年以來共取得成果和獎勵5項，發表論文40篇，參編專著8部。“
北方棉花黃萎病菌致病力分化和
落葉型菌系分子標記及其鑒別技術”獲2003年中國農科院科技進步三等獎，“棉花抗
黃萎病新種質BD18及其利用”獲1999中國農科院科技進步一等獎。