中華醫藥科學院南京新中醫學研究院是集醫、教、研於一體,針對祖國傳統醫學的開發、研究和推廣臨床最新進展教育的單位。目前下設科研技術部、江蘇省國醫館、培訓學院、附屬藥廠、器械廠等機構。
中華醫藥科學院、南京新中醫學研究院由《中國針刀醫學概覽》主編、針刀醫學培訓的倡導者和開創者,在南京和北京長期主持
針刀醫學培訓的王曉智先生親自負責。由於王曉智先生身體原因,自2008年11月開始,本院由原中華中醫藥學會針刀醫學分會常務副
秘書長兼辦公室主任、中國中醫研究院長城醫院對外辦公室主任、中國中醫研究院針刀醫學培訓中心臨床教學部主任
王自平擔任院長。