指揮使

通過了中央庭新指揮使選拔的普通少年（少女）。

他雖然沒有使用神話武器的能力，但是擁有極為罕見的輔助能力

強化、治癒、凈化、覺醒……擁有一切輔助力量的少年成為神器使們依賴的對象。

結識了多名神器使，擁有了許多夥伴，少年為了守護城市而奔走在戰場上。

但在他深入接觸了這一切之後，卻發現事情遠比表面上的複雜。

……威脅並不僅僅只是怪物而已……只有自己才能看到（希羅也看得見）的“7天”倒計時，正在一點點吞噬這個城市。

一般主線

一周目時，指揮使正在參加中央庭新指揮使選拔的考核。最終通過考試當選為新的指揮使，可之後就暈了過去，醒來之後除了自己的名字以外忘卻了所有有關交界都市的記憶。后時間進入倒計時第7天。

第7天

當指揮使“你”醒來時，第一個看到就是安和安托涅瓦。安托涅瓦會對指揮使講述中央庭，戰鬥終端，神器使等等基礎知識。中途安托涅瓦有事離開，吩咐安給失憶的指揮使介紹交界都市的詳細情況。

安給指揮使介紹了指揮使到來前城市的狀況，城市中被黑門侵佔的地區，指揮使的任務，初代指揮使希羅等。但此時中央庭出現了異常狀況，安立刻帶著指揮使去破壞黑門，指揮使順便還得到了中央庭的黑核（一周目。二周目直接凈化了黑核），之後安托涅瓦出現，詢問指揮使是否加入中央庭，如果拒絕（三周目起可選）的話將無法攻略安和安托涅瓦。

第6天

安會親自催促指揮使起床，並為指揮使做了豐盛的早餐。之後兩人同去巡查高校學園。卻發生了賽哈姆活骸化的事件。指揮使從希羅口中得知，安托涅瓦極力主張消滅活骸。當指揮使想要找辦法阻止賽哈姆的活骸化進程時，安和希羅回答活骸化是不可逆的過程。希羅希望指揮使對安托涅瓦保密賽哈姆的活骸化，以讓自己找出治療她的方法。回到中央庭彙報后，可以選擇告訴安托涅瓦真相，指揮使會詢問她是否真的定下了這條規定，而她承認了，並告訴了指揮使與第一個活骸對戰的事情。其中那個失去雙腿的神器使，可能就是她自己。

在指揮使離開后，安托涅瓦發現希羅送來的戰鬥記錄有問題，向神秘人（有可能就是少女神明）求助后，她發現真相竟然是希羅奪取了賽哈姆的幻力結晶使賽哈姆力量衰弱而變成活骸。憤怒的安托涅瓦傳送到了希羅的研究所（如果這時候指揮使也在，她會帶著指揮使和安一起傳送進房間），但最終希羅用研究價值以及自己初代指揮使的身份，斥退了安托涅瓦，而且方舟內指揮使沒能了解到情況。

如果指揮使回到中央庭向安托涅瓦報告完畢以後選擇去見希羅，安會在希羅的據點等候指揮使。此時活骸化的賽哈姆暴走，安使用時間技能想讓賽哈姆穩定下來，卻差點被殺死，場面一度失控，最終活骸化賽哈姆被安托涅瓦殺死。

第5天

安托涅瓦召集了中央庭的七人眾，並公開了希羅導致賽哈姆活骸化的事情。然而7人眾中早有4人已經歸於希羅陣營，希羅到場，引發衝突。雙方激戰後，希羅撤退，而安托涅瓦因為過度使用力量，身體開始活骸化，被送入治療中心。而希羅加快了奪取各未解放區的黑核進程。

第4天

由於中央庭的分裂和安托涅瓦開始活骸化，再加上希羅在電視媒體里大肆宣傳所謂的“新世界融合論”，導致許多神器使投奔了希羅，晏華主持大局，身體稍微穩定的安托涅瓦進行了一些文書工作。指揮使問她身體狀況時，她表示可能只有“奇迹”才能讓身體恢復，指揮使也當場許下了找到奇迹的諾言。

第3天

安出現在了希羅的據點，希羅責怪安辦事不利，跟指揮使相處的時光讓她似乎擁有了不該有的情感。安向希羅保證這一次一定會完成任務便離開了。此時出現了一個神秘女孩的聲音，通過她與希羅的對話可知，記錄賽哈姆活骸化過程的真正錄像是她提供給安托涅瓦的，她和希羅之間是合作關係。

安作為希羅方神器使的身份已經暴露，她回到中央庭，潛入病房想要攻擊安托涅瓦。結果被前來看望安托涅瓦的指揮使發現，慌忙逃走。

如果指揮使選擇追上去，安會對指揮使說她其實是希羅方在中央庭的卧底，只是一個人偶，現在已經被發現了，她很快就會被“處理”掉。最後離開了，指揮使也責怪自己為什麼沒能在有限的時間裡更加了解安。

如果指揮使選擇留下來照看安托涅瓦，指揮使會和她有一段對話。

第2天

安托涅瓦已經快到了極限。如果選擇幫助她解脫，指揮使會在衝出病房后看到來奪取安托涅瓦活骸化身體的，達爾維拉和被洗腦的安。指揮使正驚愕時，晏華告訴他這個安已經不是原來的安了。劇情戰一觸即發，勝利后安會帶著達爾維拉逃走下落不明（可能被希羅處理掉了），但還是保住了中央庭的黑核。之後指揮使會命令晏華去追擊安和達爾維拉，這幾天以來發生的事使指揮使成長了起來。

如果安托涅瓦自我了斷，指揮使會因為猶豫被洗腦後的安刺中，重傷瀕死。在迷糊中看到了安的幻象，雖然後被神秘女孩打斷並強制復活，但是達爾維拉還是在一片混亂中奪走了中央庭的黑核。

第1天

最大黑門已經敞開。