功能性神經外科是從本世紀30年代Foer-ster根據Jackson癲癇是由於皮質病灶異常放電而致的理論，手術切除癇灶，可治療癲癇開始逐漸發展為神經外科的一門分支科學。功能性神經外科的概念1956年Wertheimer首先提出。由於人類神經系統基礎科學研究的不斷發展，各種現代科學技術的不斷應用，其概念也不斷變化和充實。19世紀來，人們對神經系統的解剖學和生理學基礎有了進一步系統的認識，為現代神經外科奠定了基礎。
40年代末，立體定向技術的出現，用於治療錐體外系統疾病，現代功能性神經外科基本形成。70年代人們對神經系統的腦電生理現象有了長足認識，加上植入電極技術的誕生，功能性神經外科的概念有了新的變化，以往均為
破壞性手術，自植入
電極刺激技術出現，可以不損傷
神經組織而治療
功能性疾病。由於
顯微外科發展，可行顯微減壓術，恢復其正常功能，使功能性神經外科治療範圍進一步擴大。80年代后又出現了用
腦組織移植治療
帕金森氏病。迄今為止、功能性神經外科的手術除破壞性和刺激性手術外，又增加了重建性手術。