燕崗站

本站共有兩層，地面為工業大道南、金盛方圓廣場、江燕路、廣紙北一路，保利海棠花園等住宅小區、以及其它建築及街巷，地下一層為站廳，設有票務設施，客務中心，及商店。地下二層為廣佛地鐵站台。

本站廣佛地鐵設有一個島式站台，位於工業大道中地底。

另外，本站在廣佛地鐵站台南端設有一條存車線。廣佛地鐵開通至本站為終點站時，將利用該存車線折返所有列車。

2018年12月28日，廣佛線燕崗至瀝滘開通后，不做為終點站后，將會作為區間車終點站。

廣州地鐵11號線

11號線將經過燕崗站，與廣佛地鐵換乘。但廣佛地鐵建設之時並未預留換乘11號線，只能使用站廳通道換乘。11號線車站預計位於泉塘路，廣佛線車站的東北方。

另外，11號線站台東端預計會設置一組雙存車線，可用於折返逆時針方向的列車。

在較早的規劃中，廣佛線和11號線兩者的車站雖然均暫時命名為燕崗站，但兩線只能在沙涌站換乘，無法在本站換乘。2014年1月公示的11號線環評之中顯示，兩線在燕崗的車站在設計中相距較遠，同時不能換乘。

不過廣州市規劃局在2014年7月期間對市民諮詢的答覆中，聲稱兩線在本站將會合併設有換乘。廣州市城鄉建設委員會在9月4日發布的《廣州市軌道交通11號線工程建設通告》當中，此時11號線相比環評之中增加了一個換乘站，正式確定燕崗站成為廣佛線和11號線的其中一個換乘站。