北港溪

北港溪在阿里山西麓丘陵地帶林內鄉七星嶺發源，上游是虎尾溪，從虎尾平和厝以下稱為北港溪。其他支流甚多，分別有三疊溪、石龜溪、大湖口溪、石牛溪。是雲嘉平原的主要灌溉河川，孕育作物有稻米、花生、糖和 黃麻。最後在雲林縣口湖鄉出海。由於北港溪上游，阿里山一帶的水土皆因觀光、農業大量開發，使得北港溪的土壤沉積相當嚴重，加以下游流域廢水污染也相當嚴重，其中養豬廢水佔了45%、生活污水有35%、工業廢水則佔15%，在2006年環保薯發表水質檢測調查報告時，北港溪有47.2的河段為嚴重污染（在石榴班橋以下之河段，水質皆遭到嚴重污染，此段污染程度高達83%），比2004年的43%，增加4.2%。，列為台灣污染最嚴重的河川第一名。

北港溪，是主流域位在台灣中西部雲林縣、嘉義縣的河流。長度約有82公里，流域面積則有645.21平方公里，遍及雲林縣九個鄉鎮，分別為斗六市、斗南鎮、虎尾鎮、土庫鎮、大埤鄉、北港鎮、口湖鄉、水林鄉、古坑鄉；還有嘉義縣六個鄉鎮：溪口鄉、新港鄉、六腳鄉、東石鄉、大林鎮、梅山鄉。

北港溪由北港這個地名而來，在北港鎮通往眉原與惠蓀林場的大道上，建有台灣知名的古橋，糯米橋，此橋建於清朝光緒年間，以紅糖、糯米、蓖麻，溪石為材料，用古法建成。先民利用糯米、黑糖、石灰，代替水泥作為固定石塊的材料，因而得名。

由於北港溪上游，阿里山一帶的水土皆因觀光、農業大量開發，使得北港溪的土壤沉積相當嚴重，加以下游流域廢水污染也相當嚴重，其中養豬廢水佔了45%、生活污水有35%、工業廢水則佔15%，在2006年環保署發表水質檢測調查報告時，北港溪有47.2的河段為嚴重污染（在石榴班橋以下之河段，水質皆遭到嚴重污染，此段污染程度高達83%），比2004年的43%，增加4.2%。

1959年在台灣發生的嚴重災難─八七水災，就是暴漲洪水衝垮北港溪防洪工程溝堤后，浸淹北港市區所造成的，隔年受到雪莉颱風影響，也發生了嚴重的水患。在清朝嘉慶年間，濁水溪氾濫且發生改道的現象，南向注入北港溪，水港溪成為濁水溪的下游支流之一，而水患破壞了北港溪畔的笨港聚落。1911年興建堤防切斷濁水溪和北港溪的水道，北港溪回復到自身的河系。

北港溪和朴子溪的出海口間所形成的區域為鰲鼓濕地，屬於台糖公司所有，濕地上有水田、旱田、防風林、草澤、深水沼澤、泥質灘地等棲地類型。每年9月到次年5月是賞鳥期，觀察記錄指出水鳥約有70種，鷸科有23種，加上其他鳥類約可觀察到154種以上的鳥類。由於濕地曾計劃設立工業區，而引發當地居民與環保人士的對立，當地居民組織“趕鳥隊”，影響賞鳥活動，后因嘉義縣政府的環境評估報告無法通過，開發案暫時擱置.

北港溪

三疊溪

石龜溪 (又名華興溪、倒孔山溪)

大埔美溪

麻園溪

九芎坑溪

虎尾溪

大湖口溪

石牛溪

侖子溪

嵌頂溪

松柏坑溪

雲林溪

芭蕉溪

海豐侖溪

頭溪

牛埔子溪

埤子頭溪

石榴班溪