李晴

主要研究染色質組裝與表觀遺傳信息傳遞（Chromatin Assembly and Epigenetic Inheritance)機理。現代生命科學研究表明細胞中除了DNA以鹼基排列所編碼的基因組遺傳信息，還有以核小體為基本結構單位組成的染色質所蘊含的表觀遺傳信息。細胞分裂過程中，隨著基因組遺傳信息的高保真複製，染色質結構蘊含的表觀遺傳信息也同樣需要穩定傳遞，並且伴隨基因組遺傳信息被分配到子細胞中。染色質結構蘊含的表觀遺傳信息在子代細胞中的繼承可能會主動或者被動變化，然而其機制尚不清楚，這也是生命科學領域最本質、最神秘的問題之一，和細胞的分化、增殖及多細胞生物的發育息息相關。研究表明，該過程的失調也與多種疾病相關，例如癌症、早衰和神經退行性疾病等。

研究的長期目標著眼於解決：1）染色質結構編碼的表觀遺傳信息在細胞分裂的過程中是如何分配和傳遞的；2）該過程是如何參與維持基因組的穩定性；3）該過程失調如何導致人類疾病發生。

2017年1月，李晴研究員研究組在DNA複製偶聯的核小體組裝的機制方面做出的重要突破發表《科學》 (Science,DOI: 10.1126/science.aah4712)上，該工作發現單鏈DNA結合蛋白RPA通過結合組蛋白H3-H4，形成一個高效的平台遞呈組蛋白到新合成子鏈起始核小體組裝。這一發現揭示一條全新的DNA複製和核小體組裝的偶聯機制，大大促進染色質複製領域的發展。研究組首先發現RPA能夠直接結合組蛋白H3-H4，結合在ssDNA的RPA可以促進H3-H4和相鄰的dsDNA結合，這是核小體組裝的起始步驟；用一系列體內體外方法，包括建立一個新的ReIN-Map方法，定量分析了酵母體內全基因組水平新合成DNA上核小體的分佈，證明RPA在DNA複製偶聯的核小體組裝過程中重要作用。據此，提出在DNA複製偶聯的核小體組裝過程中，RPA-ssDNA複合物可以作為通用平台，方便多條分子伴侶呈遞組蛋白通路連接到複製叉，從而促進子鏈DNA上核小體組裝，揭示了一條新的將DNA複製和核小體組裝相偶聯的機制。

近五年研究論文

1. Jianxun Feng#, Haiyun Gan#, Matthew L. Eaton, Hui Zhou, Shuqi Li, Jason A. Belsky, David M. MacAlpine, Zhiguo Zhang* and Qing Li*, Non-codingtranscription is a driving force for nucleosome instability in spt16 mutant cells,Molecular and Cellular Biology, 2016, 36：1856-1867. （Article of significant interest selected as Spotlight)

2. Jiayi Yang#, Xu Zhang#, Jianxun Feng#, He Leng, Shuqi Li, Junyu Xiao, Shaofeng Liu, Zhiyun Xu, Jiawei Xu, Di Li, Zhongshi Wang, Jingyang Wang, Qing Li*, The histone chaperone FACT contributes to DNA replication-coupled nucleosome assembly,Cell Reports, 2016,14: 1128-1141.

3. Qing Li#, Rebecca Burgess#, and Zhiguo Zhang* , All roads lead to chromatin: Multiple pathways for histone deposition,Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms, 2012, 1819: 238-46, Review.

4. Dan Su#, Qi Hu#, Qing Li#, James R. Thompson, Gaofeng Cui, Ahmed Fazly, Brian A. Davies, Maria Victoria Botuyan, Zhiguo Zhang* and Georges Mer* , Structural basis for recognition of H3K56-acetylated histone H3–H4 by the chaperone Rtt106,Nature, 2012, 483:104-107.

5. Qing Li and Zhiguo Zhang* , Linking DNA replication to heterochromatin silencing and epigenetic inheritance, Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 2012 , 44: 3-13. Review

6. Ahmed Fazly, Qing Li, Qi Hu, Georges Mer, Bruce Horazdovsky and Zhiguo Zhang*, Histone chaperone Rtt106 promotes nucleosome formation using (H3-H4)2 tetramers,J Biol Chem , 2012 , 287:10753-60.