海南省熱帶病防治研究所設有辦公室、瘧疾室、蠕蟲室、媒介昆蟲室、中心實驗室、健康教育與情報資料室、海南省瘧疾、絲蟲病及其它寄生蟲病防治諮詢中心,下設有海南島瘧疾防治研究毛陽基地,在萬寧南橋、白沙青松等設有10個監察防治研究點。
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