古鯨亞目

約在早始新世（54MY—53MY）起源於陸生祖先，后在特提斯海（Tethys Sea，即古地中海）近熱帶的淺水區分化發展。出現了本亞目的巴基鯨科（Pakicetidae）、陸行鯨科（Ambulocetidae）和雷明頓鯨科（Remingtonocetidae）。

雷明頓鯨科（Remingtonocetidae）包括：Andrewsiphius、Remingtonocetus（雷明頓鯨屬）、Dalanistes、Attockicetus四屬。模式屬雷明頓鯨（Remingtonocetus）的吻突比前兩類古鯨更長，耳骨比前兩類大，下頜與中耳間的連接比陸行鯨類大。這些性狀與雷明頓鯨增加了水下聽覺相一致。雷明頓鯨也像陸行鯨類一樣，能用四肢支持身體。

中始新世，在南亞、非洲、歐洲、北美都發現了原鯨科（Protocetidae）的化石。原鯨類具長的吻突，大的眼，鼻孔的位置后移，後肢短小，是生活在淺海的原始鯨類。原鯨科的羅德侯鯨（Rodhocetus）腰帶與脊柱的連接減弱，提示四肢可能不能撐起身體，足很長，可能具蹼。距骨有明顯的雙滾軸狀的偶蹄動物特徵。

中始新世晚期至晚始新世早期，除南極和南美洲外的世界各大陸都發現了龍王鯨科（Basilosauridae）的化石。始新世末，古鯨亞目的多樣性逐漸 古鯨亞目（學名： Archaeoceti）即古代鯨魚，是現在鯨魚的祖先。古鯨亞目是鯨目三個亞目之中，唯一已經絕種的。古鯨亞目擁有後肢，不像今日的鯨類。最早的古鯨亞目可能完全在陸地上活動。其滅絕原因至今眾說紛紜，其中一種解釋是由於氣候變化，海洋變得過分寒冷，造成古鯨類滅絕下降，最終滅絕 古鯨亞目ArchaeocetiFlower, 1833

• 巴基鯨科Pakicetidae Gingerich e Russell, 1990

• 巴基鯨PakicetusGingerich e Russell, 1981

• 娜拉鯨NalacetusThewissen e Hussain, 1998

• 魚中獸IchthyolestesDehm e Oettingen-Spilberg, 1958

• 步鯨科Ambulocetidae Thewissen, Madar e Hussain, 1996

• 走鯨AmbulocetusThewissen, Hussain e Arif, 1994

• 甘達克鯨GandakasiaDehm e Oettingen-Spilberg, 1958

• 喜馬拉雅鯨HimalayacetusBajpai e Gingerich, 1998

• 雷明頓鯨科Remingtonocetidae Kumar e Sahni, 1986

• 安德魯斯鯨AndrewsiphiusSahni e Mishra, 1975

• 雷明頓鯨RemingtonocetusKumar e Sahni, 1986

• 大連特鯨DalanistesGingerich, Arif e Clyde, 1995

• 阿托克鯨AttockicetusThewissen e Hussain, 2000

• 庫奇鯨KutchicetusBajpai e Thewissen, 2000

• 原鯨科Protocetidae Stromer, 1908

• 埃及鯨AegyptocetusBianucci & Gingerich 2011

• 熊神鯨ArtiocetusGingerich, ul Haq, Zalmout, Khan & Malkani, 2001

• 圓齒鯨CrenatocetusMcLeod & Barnes 2008

• 加氏鯨GaviacetusGingerich, Arif e Clye, 1995

• 印支鯨IndocetusSahni e Mishra, 1975

• 慈母鯨MaiacetusGingerich et al., 2009

• 原鯨ProtocetusFraas, 1904

• 喬丹斯鯨QaisracetusGingerich,Ul-Haq, Khan e Zalmout, 2001

• 羅德侯鯨RodhocetusGingerich, Raza, Arif, Anwar e Zhou, 1994

• 泰卡鯨TakracetusGingerich, Arif e Clyde, 1995

• 多哥鯨TogocetusGingerich & Cappetta 2014

• 麥卡鯨MakaracetusP. D. Gingerich et al. 2005

• 巴比亞鯨BabiacetusTrivedy e Satsangi, 1984

• 卡羅萊鯨CarolinacetusGeisler et al. 2005

• 始原鯨EocetusFraas, 1904

• 喬治亞鯨GeorgiacetusHulbert, Petkewich, Bishop, Bukry e Aleshire, 1998

• 那支特鯨NatchitochiaUhen, 1998

• 帕坡氏鯨PappocetusAndrews, 1920

• 喬治亞鯨亞科Georgiacetinae Gingerich et al., 2005

• 麥卡鯨亞科Makaracetinae P. D. Gingerich et al. 2005

• 原鯨亞科Protocetinae Gingerich et al. 2005)

• 龍王鯨科Basilosauridae Cope, 1868

• 施特羅默鯨StromeriusGingerich, 2007

• 空齒鯨KekenodonHector, 1881

• 海豹鯨Phococetus(Delfortrie, 1873) Gervais, 1876

• 彎臂鯨AncalecetusGingerich e Uhen, 1996

• 金原鯨ChrysocetusUhen e Gingerich, 2001

• 辛西婭鯨CynthiacetusUhen, 2005

• 矛齒鯨DorudonGibbes, 1845

• 馬斯拉鯨MasracetusGingerich, 2007

• 奧庫卡赫鯨OcucajeaUhen et al. 2011

• 海鄉鯨PontogeneusLeidy, 1852

• 撒格哈鯨SaghacetusGingerich, 1992

• 死神鯨SupayacetusUhen et al. 2011

• 軛根鯨ZygorhizaTrue, 1904

• 帝王鯨BasilotritusGoldin & Zvonok 2013

• 龍王鯨BasilosaurusHarlan, 1834

• 王鯨BasiloterusGingerich, Arif, Bhatti, Anwar e Sanders, 1997

• 龍王鯨亞科Basilosaurinae Cope, 1868

• 矛齒鯨亞科Dorudontinae Miller, 1923

• 空齒鯨亞科Kekenodontinae Mitchell, 1989

• 施特羅默鯨亞科Stromeriinae Gingerich, 2007