噬菌體載體
噬菌體載體
噬菌體主主要有雙鏈噬菌體和單鏈絲狀噬菌體兩大類。雙鏈噬菌體為λ類噬菌體,單鏈絲狀噬菌體有M13、f1、fd噬菌體。重組DNA技術中常用的噬菌體克隆載體主要有λ類噬菌體和M13噬菌體。
構建λ噬菌體載體的基本原理是多餘限制位點的刪除,按照這一基本原理構建的λ噬菌體的派生載體,可以歸納成兩種不同的類型:一種是插入型載體(insertionvectors),只具有一個可供外源DNA插入的克隆位點,另一種是替換型載體(rePlacementvectors),具有成對的克隆位點,在這兩個位點之間的人DNA區段可以被外源插入的DNA片段所取代。
在基因克隆中的二者的用途不盡相同。插入型載體只能承受較小分子量(一般在10kb以內)的外源DNA片段的插入,廣泛應用於cDNA及小片段DNA的克隆。而替換型載體則可承受較大分子量的外源DNA片段的插入,所以適用於克隆高等真核生物的染色體DNA。
外源的DNA克隆到插入型的λ載體分子上,會使噬菌體的某種生物功能喪失效力,即所謂的插入失活效應。插入型的λ載體又可以分為免疫功能失活的(inactivatiortofimmunityfunction)和大腸桿菌β-半乳糖苷酶失活的(inactlvatlonofE.coliβ-galactosidase)兩種亞型。
①免疫功能失活的插入型載體:在這類插入型載體的基因組中有一段免疫區,其中帶有一兩種核酸內切限制酶的單切割位點。當外源DNA片段插入到這種位點上時,就會使載體所具有的合成活性阻遏物的功能遭受破壞,而不能進入溶源周期。因此,凡帶有外源DNA插入的λ重組體都只能形成清晰的噬菌斑,而沒有外源DNA插入的親本噬菌體就會形成混濁的噬菌斑。
②β-半乳糖苷酶失活的插入型載體:它們的基因組中含有一個大腸桿菌的lac5區段,其中編碼著β半乳糖著酶基因lacZ。由這種載體感染的大腸桿菌lac-指示菌,塗布在補加有IPTG和Xgal的培養基平板上,會形成藍色的噬菌斑。如果外源DNA插入到lac5區段上,阻斷了β-半乳糖著酶基因lacZ的編碼序列,不能合成β-半乳糖昔酶,只能形成無色的噬菌斑。
替換型載體又叫做取代型載體(substitutionvector),是一類在λ噬菌體基礎上改建的、在其中央部分有一個可以被外源插入的DNA分子所取代的DNA片段的克隆載體。
λNM781便是其中的一個代表。在這個替換型載體中,可取代的EcoRI片段,編碼有一個supE基因(大腸桿菌突變體tRNA基因),由於這種λNM781噬菌體的感染,寄主細胞lacZ基因的琥珀突變更被抑制了,能在乳糖麥康基氏(MacConkey)瓊脂培養基上產生出紅色的噬菌斑,或是在Xgal瓊脂培養基上產生出藍色的噬菌斑。如果這個具有supE基因的EcoRI片段被外源DNA取代了,那麼所形成的重組體噬菌體,在上述這兩種指示培養基上都只能產生出無色的噬菌斑。
m13噬菌體載體
該類噬菌體作為克隆載體,可以通過質粒提取技術在細菌培養物中獲取。M13噬菌體主要用於克隆單鏈DNA。