異源染色體是一個物種的一對同源染色體與另一個物種的一對形態結構不同的同源染色體的互稱。
在同一物種內,若
染色體形態、大小相同,且都是成對出現的,一個來自母親一個來自父方,這樣成對的就是
同源染色體,否則為
非同源染色體。但是如果一對染色體與另一物種的一對染色體形態、大小各不相同,則它們互為異源染色體。
舉例:二倍體西瓜與六倍體西瓜雜交的後代雖然為四倍體
西瓜,染色體組數為偶數。但是
染色體組中的染色體有異源染色體。不能正常聯會產生後代,有
生殖隔離。因此二倍體西瓜與六倍體西瓜不是同一個物種。