Peak calling是一種用於鑒定經染色質免疫沉澱-測序或MeDIP-測序實驗后所得到的比對讀段富集在基因組哪些區域中的一種計算方法。當
免疫沉澱的蛋白質是一種
轉錄因子時,那麼
DNA的富集區域就是這種它的
轉錄因子結合位點(TFBS)。主流的Peak calling軟體有MACS等。
Peak calling可應用於轉錄組/外顯組測序,亦可用於對MeRIP-測序或m6A-測序的RNA表觀基因組測序數據進行分析;利用如exomePeak等的軟體程序,可檢測出
轉錄后
RNA修飾位點。