分子生物學

分子生物學

袁紅雨 主編

出版日期：2012年11月 書號：978-7-122-14624-3

開本：16 裝幀：平 版次：1版1次 頁數：318頁

全書共12章，分為5個部分。第1、2章著重介紹了核酸和基因組的結構；第3～5章講述了DNA的複製、突變和重組；第6～8章系統分析了基因的表達過程，內容涉及RNA的生物合成、轉錄后加工以及蛋白質的生物合成與加工；第9、10章論述了原核生物和真核生物的基因表達調控；第11、12章對分子生物學研究方法進行了專題介紹，內容包括核酸的分離、純化、檢測和雜交，基因克隆，聚合酶鏈式反應，DNA測序和基因組測序，基因表達分析以及蛋白質組學研究等。

全書可供生命科學相關專業的教師、本科生和研究生使用。

第1章核酸的結構與性質

11DNA的結構

111DNA的化學組成

112DNA雙螺旋

113DNA結構的多態性

12DNA超螺旋

121超螺旋DNA

122共價閉合環狀DNA的拓撲結構

123超螺旋密度

124拓撲異構酶

125嵌入劑

13DNA的變性和復性

131DNA變性

132復性

14RNA結構

第2章基因組DNA

21原核生物的基因組和染色體

211原核生物基因組的遺傳結構

212原核生物的染色體

22真核生物的基因組

221真核生物的C值矛盾與非編碼DNA

222真核生物基因組的序列組分

23真核生物的染色體和染色質

231組蛋白

232核小體

233從核小體到中期染色體

234異染色質與常染色質

235真核生物染色體DNA上的幾個重要元件

24核外基因組

241質粒基因組

242線粒體基因組

243葉綠體基因組

第3章DNA的複製

31DNA複製的一般特徵

311半保留複製

312複製起點與複製子

313DNA合成的引發

314半不連續複製

315滾環複製與D環複製

32大腸桿菌染色體DNA的複製

321複製的起始

322複製的延伸

323複製的終止

324複製起始調控

33真核生物DNA複製

331SV40 DNA的複製

332真核生物基因組複製的調控

333核小體的組裝

334端粒DNA複製

34反轉錄

341反轉錄病毒的結構

342反轉錄病毒的基因組

343反轉錄過程

344原病毒DNA的整合

第4章DNA的突變、損傷和修復

41DNA突變

411突變的主要類型

412突變的產生

413正向突變、回復突變與突變的校正

414突變熱點

42DNA修復

421光復活

422烷基的轉移

423核苷酸切除修復

424鹼基切除修復

425錯配修復

426極小補丁修復

427重組修復

428SOS反應

429真核生物的DNA修復

第5章DNA重組

51同源重組

511同源重組的分子模型

512大腸桿菌的同源重組

513真核細胞的同源重組

514交配型轉換

515基因轉換

52位點特異性重組

53轉座

531DNA轉座子

532反轉錄轉座子

533Mu噬菌體

第6章RNA的生物合成

61原核生物的轉錄機制

611大腸桿菌RNA聚合酶

612σ70啟動子

613原核生物的轉錄

62真核生物的轉錄機制

621真核生物RNA聚合酶

622RNA Pol Ⅰ基因的轉錄

623RNA Pol Ⅲ基因的轉錄

624RNA Pol Ⅱ基因的轉錄

第7章轉錄后加工

71真核生物前體mRNA的加工

7115′端加帽

7123′端加尾

713剪接

714RNA編輯

715RNA運出細胞核

72mRNA降解

721原核生物mRNA的降解

722真核生物mRNA的降解

73前體rRNA和前體tRNA的加工

731原核生物rRNA前體的加工

732真核生物rRNA前體的加工

733原核生物tRNA前體的加工

734真核生物tRNA前體的加工

74四種內含子的比較

741細胞核前體mRNA的GUAG型內含子

742Ⅰ型內含子

743Ⅱ型內含子

744真核生物前體tRNA內含子

第8章蛋白質的生物合成

81遺傳密碼

811遺傳密碼是三聯體

812遺傳密碼的破譯

813密碼子的特性

82tRNA

821tRNA分子的二級結構

822tRNA分子的三級結構

823密碼子和反密碼子的相互作用

83氨醯tRNA合成酶

831氨醯tRNA合成酶催化的化學反應

832氨醯tRNA合成酶的分類

833氨醯tRNA合成酶對tRNA的識別

834氨醯tRNA合成酶的校正功能

84核糖體

841核糖體的結構

842核糖體循環

843肽醯轉移酶反應

85多肽鏈的合成

851原核生物多肽鏈的合成

852真核生物多肽鏈的合成

86反式翻譯

861tmRNA的結構與功能

862反式翻譯的分子模型

87程序性核糖體移碼

88硒代半胱氨酸

89吡咯賴氨酸

810依賴翻譯的mRNA質量監控

8101無義密碼子介導的mRNA降解

8102無終止密碼子介導的mRNA降解

811蛋白質合成的抑製劑

812蛋白質翻譯后加工

8121蛋白質的摺疊

8122蛋白質的化學修飾

8123蛋白質的酶解切割

8124內含肽與蛋白質拼接

813蛋白質的定向與分揀

8131翻譯轉運途徑

8132翻譯後轉運途徑

814蛋白質的降解

8141溶酶體降解途徑

8142泛素蛋白酶體途徑

第9章原核生物基因表達的調控

91轉錄水平的基因表達調控

911轉錄起始調控

912轉錄終止階段的調控

92翻譯水平的調控

921反義RNA

922核糖體蛋白的自體控制

923一些mRNA分子必須經過切割才能被翻譯

924嚴緊反應

93核開關

94DNA重排對基因轉錄的調控

95λ噬菌體調控級聯

951裂解周期中的級聯調控

952溶源生長的自體調控

953溶源生長建立的分子機制

954裂解生長和溶源生長的選擇

955前噬菌體的誘導

第10章真核生物基因表達的調控

101染色質的結構與基因表達

1011位置效應

1012活性染色質的形態特徵

1013染色質結構的調節

1014染色質結構的區間性

102DNA甲基化與基因組活性調控

1021真核生物DNA的甲基化

1022DNA甲基化與基因沉默

1023DNA甲基化與基因組印記

1024X染色體失活

103真核生物的特異性轉錄因子

1031轉錄因子的分離與鑒定

1032轉錄因子的功能域

104轉錄因子的作用方式

1041活化子

1042抑制子

105轉錄因子活性的調節

1051轉錄因子的表達調控

1052信號分子對轉錄因子活性的調節

106轉錄后水平的基因表達調控

107翻譯水平的基因表達調控

1071mRNA結合蛋白對翻譯的調控

1072翻譯激活因子對翻譯的激活作用

108DNA重排與抗體基因的組裝

1081抗體的分子結構

1082抗體基因的結構及其重排

109RNA介導的基因沉默

1091RNA干擾

1092轉錄后基因沉默

1093雙鏈RNA對基因組的調節

1094微小RNA

第11章分子生物學方法Ⅰ

111核酸的分離、純化、檢測和雜交

1111DNA的分離和純化

1112DNA凝膠電泳

1113脈衝場凝膠電泳

1114變性梯度凝膠電泳

1115DNA的化學合成

1116完整基因的化學合成

1117肽核酸

1118用紫外線檢測DNA和RNA的濃度

1119核酸的放射性標記

11110放射性標記DNA的檢測

11111DNA和RNA的熒光檢測

11112用生物素和地高辛標記DNA

11113Southern和Northern印跡雜交

11114熒光原位雜交

11115分子信標

112基因克隆

1121工具酶

1122基因克隆的載體

1123基因文庫

113聚合酶鏈式反應

1131PCR簡介

1132簡併引物

1133反向PCR

1134PCR產物的克隆

1135隨機擴增多態性DNA

1136反轉錄PCR

1137差異顯示PCR

1138快速cDNA末端擴增

1139定點突變

11310PCR介導產生融合基因

11311實時熒光定量PCR

第12章分子生物學方法Ⅱ

121DNA測序和基因組測序

1211DNA測序

1212基因組測序

122基因表達分析

1221報告基因

1222上游序列的缺失分析

1223確定上游調控區中的蛋白質結合位點

1224轉錄起始位點的確定

1225轉錄組分析

123蛋白質組學

1231蛋白質電泳

1232雙向PAGE電泳

1233蛋白質Western印跡

1234蛋白質標籤系統

1235噬菌體展示

1236酵母雙雜交系統

1237免疫共沉澱

參考文獻