NF-κB

NF-κB家族成員與逆轉錄病毒癌蛋白v-Rel有結構上的同源性，因此將他們歸類為NF-κB/Rel蛋白。在哺乳動物中該家族有5種蛋白，分別為：RelA（p65），RelB，c-Rel，p50和p52。它們的N端有著高度保守Rel同源區（Rel homology region，RHR），RHR由N端結構域（N-terminal domain，NTD）和C端結構域（C-terminal domain，CTD）連接而成，在CTD上有一個核定位區域(nuclear-localization sequence，NLS)，負責與DNA結合、二聚體化和核易位。RelA（p65）、c-Rel和RelB的C端存在反式激活結構域（transactivation domain，TD）使得其激活目標基因。p50和p52隻有RHR而缺乏TD，因此，p50和p52同源二聚體並不能激活基因轉錄，而是作為一種抑制分子存在，它們在細胞內通常各自以其前體p105和p100的形式存在。

NF-κB結合DNA的結構最早是在成熟B細胞免疫球蛋白κ-輕鏈基因的增強子上被發現，兩個亞基形成的同源和/或異源二聚體與靶基因上10bp特定的序列（-κB 位點）結合調節基因轉錄，不同的NF-κB二聚體在選擇結合序列時可能略有差異，這是NF-κB通過不同的二聚體的形式對不同基因的表達進行精細調節的一種方式，但結合的模式基本相同。NF-κB的兩個RHR組裝成蝴蝶樣結構，中間有一個孔可以讓DNA穿過。CTD負責兩個蛋白的二聚，以及DNA的磷酸化，NTD可以特異性識別DNA鹼基序列以及非特異性結合DNA的磷酸骨架。

最常見的NF-κB二聚體是RelA（p65）與 p50組成的異二聚體。

NF-κB二聚體的抑制蛋白家族（IκB）包含傳統的IκB蛋白（IκBα，IκBβ，IκBε），NF-κB前體蛋白（p100，p105），以及核IκB(IκBζ ， Bcl-3， and IκBNS)。

IκB通過其C末端特定的錨蛋白重複序列(ankyrin repeat–containing domain ，ARD)與NF-κB結合，並覆蓋NLS阻止NF-κB向細胞核內轉移。

由於在其C末端半部存在錨蛋白重複，p105和p100也起IκB蛋白的作用。p100的c-末端一半（通常稱為IκBδ）也起抑製劑的作用。IκBδ響應發育刺激而降解，例如通過LTβR轉導的刺激，在NIK依賴的非經典途徑中加強NF-κB二聚體活化。

NF-κB信號通路是由細胞外的刺激引起的。細胞外信號因子與細胞膜上的受體結合，開啟了一連串下游的反應。受體蛋白接受刺激后先活化IκB激酶（IKK）。IKK將細胞內NF-κB·IκB複合物的IκB亞基調節位點的絲氨酸磷酸化，使得IκB亞基被泛素化修飾，進而被蛋白酶降解，從而釋放NF-κB二聚體。自由的NF-κB會進入細胞核，與有NF-κB結合位點的基因結合，啟動轉錄進程。NF-κB也會激活IκBα基因的表達，新和成的IκBα重新抑制NF-κB的活性，從而形成了自發負反饋環，這樣的設計原理將形成NF-κB振蕩的現象。

NF-κB在調節細胞反應中是相當重要的，因為它屬於“快速作用”的初級轉錄因子，不需要新的蛋白質合成就能被激活（有該特性的其他成員包括c-Jun，STAT和核激素受體）。NF-κB是對有害細胞刺激的第一反應者。已知的NF-κB通路激活因子有很多，包括：TNF-α、IL-1β、IL-2、IL-6、IL-8、IL-12、iNOS、COX2、趨化因子、粘附分子、集落刺激因子等。此外，鋅指蛋白A20、血紅素加氧酶-1 (HO-1)等一些抗炎和與細胞凋亡有關的分子如：腫瘤壞死因子受體相關因子-1（tumour-necrosis factor receptor associated factor -1，TRAF-1），抗細胞凋亡的蛋白-1和-2（inhibitor of apoptosis 1/2 ， IAP1/ IAP2），TNF 受體相關因子（receptor–associated factors ，TRAF1 /TRAF2），Bcl-2 同源體 A1/Bfl-1和 IEX-IL也都受NF-κB的調控。

NF-κB受體激活劑（RANK）是一種TNFR，是NF-κB的中樞激活劑。骨保護劑（OPG）是RANK配體（RNAK ligand，RNAKL）的誘餌受體同系物，通過結合RANKL來抑制RANK，因此骨保護素與NF-κB的調控緊密相關。

許多細菌的代謝產物和各種表面受體的活化導致NF-κB通路的激活，快速改變基因的表達。Toll樣受體（Toll-like receptors，TLRs）作為一種特殊的識別分子，它對NF-κB通路的激活增加了我們對不同病原體激活NF-κB通路的理解。TLR是先天性和適應性免疫應答的關鍵調節因子。