位於台北竹子湖和陽明山后的陽明書屋藏有著名的“大溪檔案”。“大溪檔案”收藏了蔣介石1921年初至1949年間的公文、信函、手令、手稿、筆記等，這些檔案涉及北伐戰爭、中山艦事件、井岡山四次圍剿、西安事變以及國共合作期間國民黨內部爭鬥等情況，其內容之豐富、機密性之高可以想見。
“大溪檔案”藏於一間有100平方米的地下室，除該室外的其他地方，都屬於國民黨黨史會收藏其黨史資料的重要場所。“大溪檔案”因早先存放於大溪賓館，故名。1979年，這些珍貴檔案從大溪遷至陽明書屋。“大溪檔案”早時保管嚴密，專家學者無緣研究參觀。20世紀70年代末搬遷陽明書屋后，蔣介石已去世，不少遠道慕名的來訪學者方可走馬觀花一番。據統計，至1991年2月，進入陽明書屋的參觀者約有6000人，其中約有500人研究使用過“大溪檔案”。為史學者震動的是，台灣當局曾向日本提供過數量巨大的“大溪檔案”。