PDZ結構域

PDZ結構域

結構域(structural domain)是介於二級和三級結構之間的另一種結構層次。

名詞解釋


所謂結構域是指蛋白質亞基結構中明顯分開的緊密球狀結構區域,又稱為轄區。多肽鏈首先是在某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級結構,然後,又由相鄰的二級結構片段集裝在一起形成超二級結構,在此基礎上多肽鏈摺疊成近似於球狀的三級結構。對於較大的蛋白質分子或亞基,多肽鏈往往由兩個或多個在空間上可明顯區分的、相對獨立的區域性結構締合而成三級結構,這種相對獨立的區域性結構就稱為結構域。對於較小的蛋白質分子或亞基來說,結構域和它的三級結構往往是一個意思,也就是說這些蛋白質或亞基是單結構域。結構域自身是緊密裝配的,但結構域與結構域之間關係鬆懈。結構域與結構域之間常常有一段長短不等的肽鏈相連,形成所謂鉸鏈區。不同蛋白質分子中結構域的數目不同,同一蛋白質分子中的幾個結構域彼此相似或很不相同。常見結構域的氨基酸殘基數在100~400個之間,最小的結構域只有40~50個氨基酸殘基,大的結構域可超過400個氨基酸殘基。

具體描述


PDZ結構域,或者叫做“盤狀同源區域”,是一種由80到100個氨基酸殘基組成的保守序列,最初的名稱是“突觸前密度蛋白”PSD-95,或者DLG4(是“膜相關性鳥苷酸激酶”蛋白家族的一種)。在真核生物中,PDZ結構域通常表現為串聯重複拷貝。由80到90個氨基酸殘基組成,包含兩個α螺旋和六個β摺疊。生物作用主要是介導膜上的蛋白聚集,結合目標蛋白的C端,目標蛋白結合在由PDZ結構域第一個α螺旋和第二個β摺疊所構成的溝內。