生色團

分吸收通常表現為n →π*和π→π*躍遷，因而吸收範圍多在200～800nm之間。如果分子中含有兩個或多個共軛的生色團時，分子對光的吸收移向長波方向，共軛體系越長，吸收光的波長越長，當物質吸收光的波長移至可見光區域時，該物質就有了顏色。如果在同一分子內有幾個發色團，或有稱作助色團的另一基團存在時，則顏色往往較深。助色團是含孤對電子的基團，如氨基、羥基和鹵代基等。這些基團與生色團上的不飽和鍵作用，使顏色加深。

這類基團與不含非鍵電子的飽和基團成鍵后，使該分子的最大吸收位於200nm或200nm以上，摩爾吸光係數較大(一般不小於5000)。簡單的生色團由雙鍵或叄鍵體系組成，例如，>C=C<，>C=O，-N=N-，-C C-，-C N-等。分子結構的某些基團吸收某種波長的光，而不吸收另外波長的光，從而使人覺得好像這一物質"發出顏色"似的，因此把這些基團又稱為"發色基團/發色團"。例如，無機顏料結構中有發色團，如鉻酸鹽顏料是（重鉻酸根），呈黃色；氧化鐵顏料的發色團是 呈紅色；鐵藍顏料的發色團是 呈藍色。這些不同的分子結構對光波有選擇性的吸收，反射出不同波長的光。

染料的顏色取決於其分子結構。按Wiff發色基團學說, 染料分子的發色體中不飽和共軛鏈( 如- C= C- 、- N = N - 、- N = O）的一端與含有供電子基(如- OH、- NH2)或吸收電子基(如- NO2、>C = O ) 的基團相連, 另一端與電性相反的基團相連。化合物分子吸收了一定波長的光量子的能量后, 發生極化併產生偶極矩, 使價電子在不同能級間躍遷而形成不同的顏色。一般來說, 染料分子結構中共軛鏈越長, 顏色越深; 苯環增加, 顏色加深; 分子量增加, 特別是共軛雙鍵數增加，顏色加深。

例如苯的衍生物具有可見光區吸收帶。這些衍生物顯不的吸收帶與其價鍵的不穩定性有關，如對苯二酚為無色，當其氧化后失去兩個氫原子，它的分子或則變為有黃色的對醌，這種產生顏色的醌式環就是發色團。若一種化合物含有幾個環，只要其中有一個醌式環就會發出顏色，稱此發色團為色原（chromogen）。

常利用蛋白質含有的生色團進行光譜學檢測，研究蛋白質性質。蛋白質主要的生色團為色氨酸，酪氨酸和苯丙氨酸