5-羥甲基胞嘧啶
5-羥甲基胞嘧啶
5-羥甲基胞嘧啶 5-hydroxymethylcytosine的分子式是C5H7N3O2,是5- 甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC) 的羥基化形式,5-羥甲基胞嘧啶是TET家族的酶通過氧化5-甲基胞嘧啶(5-mC)產生的,被稱為“第六種鹼基”,可以調控基因表達的關閉,是一種重要的表觀遺傳修飾,可能與去甲基化過程有關,5-羥甲基胞嘧啶的具體作用機制還不明確。
5-羥甲基胞嘧啶最早於1952 年在噬菌體DNA中被發現, 它能被糖基轉移酶介導糖基化修飾, 從而使噬菌體基因組在進入宿主后能抵抗宿主限制酶的降解。1972年Penn等在哺乳動物大鼠、小鼠 以及卵生動物牛蛙腦組織提取的DNA中也發現了羥基化修飾的胞嘧啶, 約佔DNA總胞嘧啶的15% 左右,但此後的研究未能重複這一結果。直到2009 年,Tahiliani和Kriaucionis的兩個研究團隊在同一期Science中分別報道了5hmC 在人、小鼠大腦及胚胎幹細胞中有著豐富表達, 羥甲基化的概念才又一次進入人們的視野並得到了重視。目前5hmC是繼5mC被稱為“第5 個鹼基”之後的“第6 個鹼基”。
5-羥甲基胞嘧啶在哺乳動物的不同組織間存在差異性分佈, 這種差異還會隨著年齡、疾病等因素髮生變化。所有的哺乳動物基因組中都含有5-羥甲基胞嘧啶,但是其水平在不同類型細胞中相差很大,在中樞神經系統的神經細胞中含量最高。