陳實

武漢大學藥學院教授

陳實教授,楚天學者特聘教授 博士生導師 國家青年專家。

以第一作者或通訊作者在Nature Chemical Biology, Nature Communications,PNAS, Nucleic Acids Research, Chemistry & Biology, Scientific Reports, Applied and Environmental Microbiology, Protein & Cell 等發表論文。任Microbiological Research副主編,Scientific Reports、Frontiers in Toxicogenomics編委,獲邀JACS、Nucleic Acids Research、Metabolic Engineering等18個英文學術雜誌審稿人。相關研究成果被Nature Chemical Biology (News and Views),Chemical & Engineering News,Nature China,ScienceDaily,Faculty of 1000 等專門報道。

基本情況


本科畢業於華中農業大學本碩連讀班,於上海交通大學獲博士學位,先後赴美國麻省理工學院和哈佛大學進行博士后研究。

學習工作簡歷


1994.9 – 2000.7 華中農業大學生物技術六年制本碩連讀專業。
2000.9 – 2004.10獲上海交通大學生物化學與分子生物學博士學位。
2001.3 – 2002.8 作為訪問博士生赴韓國高等科技學院合作研究。
2005.3 – 2007.6 赴美國麻省理工學院進行博士后研究。
2007.7 – 2011.8在美國哈佛大學進行博士后研究。
2011.9聘任武漢大學藥學院教授。

研究方向


1.基因組修飾及編輯
利用最新發展的前沿技術,對細胞基因組進行精確地修飾和編輯,結合表觀遺傳學、基因組學、蛋白組學等,發展出特定設計的工程細胞,並解析這些表觀遺傳學修飾或改造對細胞生命活動的影響。
2.DNA骨架的磷硫醯化生理修飾
與任何DNA或RNA修飾不同,DNA的磷硫醯化是DNA骨架上發現的第一例生理修飾,又稱為DNA 骨架上的硫修飾,或DNA的第六元素。入選《環球科學》2007 年度“全球十大科學新聞”。磷硫醯化修飾由dnd 基因簇的一系列基因來完成,在不同的細菌宿主中表現出識別序列特異性,空間構象特異性。磷硫醯化修飾拓展了DNA的元素組成並豐富了DNA 結構,打開了一個新的學科領域。
3.創新藥物的設計與改造
依據藥物生物合成的機理及對重大疾病致病機理的認識,合理篩選並設計潛在藥物,並通過合成生物學、基因工程、蛋白質工程、代謝工程及組合生物合成途徑進行優化改造,以獲得性能改善並可應用於臨床的創新藥物。
4. 神經退行性疾病的致病機理與治療途徑
神經退行性疾病包括阿爾茲海默症、肌萎縮脊髓側索硬化症、帕金森氏病、亨廷頓氏病等,是困擾人類健康的重大疾病。神經退行性疾病發病機理迄今不清楚,沒有任何有效的治療手段。通過最新發展起來的前沿技術,建立這些重大疑難疾病的病理細胞模型、動物模型和理論依據。通過全面的致病機理和病理分析,發展相應的創新藥物和治療手段,達到治療的最終目的。

學術論文


1. Wang L.*, Chen S.*, Xu T., Taghizadeh K., Wishnok J., Zhou X., You D., Deng Z, Dedon P. Phosphorothioation of DNA in bacteria by dnd genes. Nature Chemical Biology, 2007, Nov; 3(11): 709-710. (*co-first author)
各界評論:
(1) 《環球科學》2007年度全球十大科學新聞, 2008年1月刊:《發現DNA的第六元素》
(2) Fritz Eckstein. Nature Chemical Biology 《自然化學生物學》, 新聞與視角, Phosphorothioation of DNA in bacterial. 2007, Nov; 3(11), 689-690.
(3) Carmen Drahl. Chemical & Engineering News 《化學與工程新聞》. DNA Backbone Swaps In Sulfur – Common artificial DNA modification also occurs in nature. 2007, Oct 22: p14.
4) Felix Cheung. Nature China 《自然。中國》. DNA chemistry: Sulphur degradation. 2007, Oct 24: doi:10.1038/nchina.2007.223
2. Wang L, Chen S*, Vergin KL, Giovannoni SJ, Chan SW, Demott MS, Taghizadeh K, Cordero OX, Cutler M, Timberlake S, Alm EJ, Polz MF, Pinhassi J, Deng Z, Dedon PC*. DNA phosphorothioation is widespread and quantized in bacterial genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2011 Feb; 108 (7): 2963-2968. (*corresponding author)
3. Chen S.*, Galan M. C.*, Carla Coltharp, OConnor S. E. Redesign of a central enzyme in alkaloid biosynthesis. Chemistry & Biology, 2006 Nov; 13(11): 1137-41. (*co-first author)
4. Chen S, Huang X, Zhou X, Bai L, He J, Jeong KJ, Lee SY, Deng Z. Organizational and mutational analysis of a complete FR-008/candicidin gene cluster encoding a structurally related polyene complex. Chemistry & Biology, 2003 Nov; 10(11): 1065-76.
5. Chen S. *, Mao X.*, Shen Y., Zhou Y., Li J., Wang L., Tao X., Yang L., Wang Y., Zhou X., Deng Z., Wei D. Tailoring the P450 monooxygenase gene for FR-008/candicidin biosynthesis. Applied and Environmental Microbiology, 2009, Mar; 75(6): 1778-81 (*co-first author)
6. Chen S. *, Wang L., Deng Z*. Twenty years hunting for sulfur in DNA. Protein & Cell, 2010, Jan; 1(1): 14-21. (*corresponding author)
7. Wang L., Chen S., Deng Z. Phosphorothioation: an unusual post-replicative modification on the DNA backbone. Book Chapter. In DNA replication. 2011.
http: //www./articles/show/title/phosphorothioation-an-unusual-post-replicative-modification-on-the-DNA-backbone
8. Wang L, Chen S, Xiao X, Huang X, You D, Zhou X, Deng Z. arsRBOCT arsenic resistance system encoded by linear plasmid pHZ227 in Streptomyces sp. Strain FR-008. Applied and Environmental Microbiology, 2006 May; 72(5): 3738–3742.
9. Mao X., Chen S., Shen Y., Wei D, Deng Z. Effect of copper sulfate on biosynthesis of FR-008/Candicidin complex production in Streptomyces sp. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2011, 27(9): 2033-2039.
10. Xu T., Liang J., Chen S., Wang L., He X., You D., Wang Z., Li A., Xu Z., Zhou X., Deng Z. DNA phosphorothioation in Streptomyces lividans: Mutational analysis of the dnd locus. BMC Microbiology. 2009 Feb 20;9(1):41.
11. Zhou Y., Li J., Zhu J., Chen S., Bai L., Zhou X., Wu H., Deng Z. Incomplete beta-Ketone Processing as a Mechanism for Polyene Structural Variation in the FR-008/Candicidin Complex. Chemistry & Biology, 2008, June; 15(6): 629-38.
12. Yan B, Kong M, Chen S, Chen Y. VEGF stimulation enhances Livin protein synthesis through mTOR signaling. Journal of Cellular Biochemistry, 2010, Dec; 111(5): 1114-1124.
13. Mao X., Shen Y., Yang L., Chen S., Yang Y., Yang J., Zhu H., Deng Z., Wei D. Optimizing the medium compositions for accumulation of the novel FR-008/Candicidin derivatives CS101 by a mutant of Streptomyces sp. using statistical experimental methods. Process Biochemistry, 2007, May; 42(5): 878-883.
14. Zhou Y., Meng Q., You D., Li J., Chen S., Ding D., Zhou X., Zhou H., Bai L., Deng Z. Selective removal of the aberrant extender units by a type II thioesterase for the efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. FR-008. Applied and Environmental Microbiology, 2008, Dec;74(23):7235-7242.
15. Mao X., Wang F., Zhang J., Chen S., Deng Z., Shen Y., Wei D. The pH Shift and Precursor Feeding Strategy in a Low-Toxicity FR-008/Candicidin Derivative CS103 Fermentation Bioprocess by a Mutant of Streptomyces sp. FR-008. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2009, Dec;159(3):673-86
16. Yerker N., Wu J. X., McCoy E., Galan C., Chen S., O’Connor S. E. Substrate specificity and diastereoselectivity of strictosidine glucosidase, a key enzyme in monoterpene indole alkaloid biosynthesis. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2008, May; 18(10): 3095-3098.

業績概要


以第一作者或通訊作者在Nature Chemical Biology、PNAS、Chemistry & Biology、Applied and Environmental Microbiology、Protein & Cell 等發表論文。
任Frontiers in Toxicogenomics編委,獲邀9 個英文學術雜誌審稿人。

所獲獎勵


2014年 中國微生物學會學術年會優秀學術論文獎
2013年 湖北省醫學領軍人才培養工程
2013年 湖北省特聘專家
2012年 武漢大學醫學部醫學突出貢獻獎
2012年 國家青年
2008年 中國國家自然科學獎二等獎
2008年 新加坡陳嘉庚基金會第六屆陳嘉庚青少年發明獎(上海)(銅獎)
2007年《環球科學》2007年度全球十大科學新聞
2007年 上海市優秀髮明獎選拔賽二等獎
2007年 新加坡陳嘉庚基金會第五屆陳嘉庚青少年發明獎(上海)(銅獎)
2006年 上海市研究生學位論文優秀成果
2004年 上海市科技進步一等獎
2004年 上海市新長征突擊手“標兵”
2004年 新加坡陳嘉庚基金會第二屆陳嘉庚青少年發明獎(上海)(銀獎)
2004年 明治乳業生命科學優秀獎
2004年 上海-聯合利華研究與發展基金獎學金