16s rRNA

16S rRNA具有高度的保守性和特異性以及該基因序列足夠長（包含約50個功能域）。隨著PCR技術的出現及核酸研究技術的不斷完善，16S rRNA基因檢測技術已成為病原菌檢測和鑒定的一種強有力工具。資料庫的不斷完善，應用該技術可以實現對病原菌進行快速、微量、準確簡便地分類鑒定和檢測。該技術主要有三個步驟：首先是基因組DNA的獲得，其次是16S rRNA基因片段的獲得，最後是進行16S rRNA基因序列的分析。

核蛋白體RNA( ribosomal RNA, rRNA)是細胞內含量最多的RNA，約佔RNA總量的80%。rRNA與核蛋白體蛋白(ribosomalprotein)共同構成核蛋白體(ribosome)。核蛋白體中的rRNA和核蛋白體蛋白共同為蛋白質生物合成所需要的mRNA、tRNA以及多種蛋白因子提供了相互結合和相互作用的空間環境。

原核生物有三種rRNA。依照它們的沉降係數可分為5S、16S、23S。它們分別與不同的核蛋白體蛋白質結合分別形成了核蛋白體的大亞基(largesubunit)和小亞基(smallsubunit)。真核生物的四種rRNA也利用類似的方式構成了核蛋白體的大亞基和小亞基。

16S rRNA 即 16S ribosomal RNA，是原核核糖體30S小亞基的組成部分。16S中的"S"是一個沉降係數，亦即反映生物大分子在離心場中向下沉降速度的一個指標，值越高，說明分子越大。

16S rRNA具有多項功能。

1.對於核糖體蛋白的固定起到腳手架的作用。

2.3'末端包含反向的SD序列，用來與mRNA的AUG起始密碼子結合。16S rRNA的3'端與S1、S21的結合被發現與蛋白質合成的開始有關係。

3.與23S進行交互，幫助兩個核糖體子單元的結合。（50S+30S）

4.在A site 穩定密碼子與反密碼子的正確配對。