CAPs(cleaved amplification polymorphism sequence-tagged sites) CAPs技術又稱為PCR-RFLP，限制性片段長度多態性聚合酶鏈反應（PCR-RFLP）技術。是用特異設計的PCR引物擴增目標材料時，由於特定位點的鹼基突變、插入或缺失數很少，以至無多態出現，往往需要對相應PCR擴增片段進行酶切處理，以檢測其多態性。CAPs標記在二倍體植物研究中可發揮巨大的作用，是PCR標記的有力補充。但在多倍體植物中的應用有一定的局限性。另外，CAPs標記需使用內切酶，這又增加了研究成本，限制了該技術的廣泛應用。
PCR-RFLP的基本原理是用PCR擴增目的
DNA，擴增產物再用特異性內切酶消化切割成不同大小片段，直接在
凝膠電泳上分辨。不同
等位基因的限制性酶切位點分佈不同，產生不同長度的DNA片段條帶。此項技術大大提高了目的DNA的含量和相對特異性，而且方法簡便，分型時間短。
2.提取基因組DNA。
3.PCR擴增。
4.產物酶切，凝膠電泳。
這種方法與
RFLP相比，不同的是以擴增替代了酶切，避免了RFLP繁瑣的
DNA酶切、轉移、雜交等步驟。