御葯院

北宋太宗三年，將尚藥局的內葯院更名為“御葯院”，隸屬內侍省，崇寧二年又改歸殿中省。這樣便形成了尚藥局、御葯院共同供奉御葯的局面。御葯院以入內供奉官掌管。宋徽宗二年，增置內臣監官為御葯院的奉御，以院官使為醫師，以醫官使為御醫；醫官副使為醫正，醫官為醫佐；雜役秤子、搗碾子類為葯工。

御葯院主要職能有：保管、加工、炮製國內外進貢到宮廷的藥物，組織採購藥材；奏敕出使頒賜施散藥物，若大臣有病，皇帝常派出御葯院的醫官前去賜葯，在疫病流行之時，御葯院也經常和翰林醫官院共同派醫官赴災區送葯；有時御葯院掌禮文兼受行典禮及貢舉之事；御葯院和尚藥局共同負責御葯的供奉。御葯院之設立，使得北宋全國性藥材管理工作獲得加強，這與設立翰林醫官院同樣是北宋醫藥管理機構改革的成果。

金朝宮廷內設有尚藥局、御葯院，其中尚藥局隸屬宣徽院。金朝攻佔北宋汴京，擄回宋徽宗、宋欽宗的同時，還擄回北宋宮廷的諸科醫生數百人，還有不少醫書及藥品，其中僅北宋太醫局的靈寶丹便有28700貼。

元朝初期，隨著貢來的藥品增多，遂在至元六年設立御葯院，負責管理藥品製作及儲存，“秩從五品，掌授各路鄉貢，諸蕃進獻珍貴藥品，修造湯煎。”這時仍然設有尚藥局，後來由於尚食局和尚藥局常在葯膳方面發生聯繫，故在至元二十年（1354年）省並尚藥局為尚食局。此後御葯院和太醫院共同形成了元朝醫藥管理的最高機構。

明朝未設御葯院，而設有御藥局，后改稱聖濟殿，清朝設御藥房。