反式作用因子

轉錄模板上游的蛋白調節因子

反式作用因子是轉錄模板上游的一類蛋白調節因子,包括激活因子和阻遏因子等,它們與順式作用元件中的上游激活序列特異性結合,對真核生物基因的轉錄分別起促進和阻遏作用。

概述


參與基因表達調控的因子,它們與特異的靶基因的順式元件結合起作用。編碼反式作用因子的基因與被反式作用因子調控的靶序列(基因)不在同一染色體上。反式作用因子有兩個重要的功能結構域:DNA結合結構域和轉錄活化結構域,它們是其發揮轉錄調控功能的必需結構,此外還包含有連接區。反式作用因子可被誘導合成,其活性也受多種因素的調節。

結構


同一類序列特異性的反式作用因子由多基因家族所編碼,它們具有特定的蛋白質結構(如上述的鋅指結構、鹼性亮氨酸拉鏈、螺旋-環-螺旋基元等)和蛋白質結構上的同源性,因而構成反式作用因子家族,如類固醇激素受體家族、AP1家族等。
主要包括:
1.DNA結合域:
a.螺旋-轉角-螺旋
b.鋅指結構
c.亮氨酸拉鏈
d.螺旋-突環-螺旋
2.轉錄激活域:與其他轉錄因子相互作用的結構成分。常見的轉錄激活結構域有富含谷氨醯胺結構域,富含脯氨酸結構域及酸性α螺旋結構域。
隨著表觀遺傳學的發展,研究發現除了蛋白,DNA、RNA也有調控功能,所以現在也稱反式調控元件,主要有miRNA,轉錄因子等。

分類


①通用轉錄因子。普遍存在的轉錄因子,具有識別啟動子元件功能的基本轉錄因子。
元件名稱共有序列結合的蛋白因子名稱分子量結合DNA長度
TATAboxTATAAAATBP30,000~10bp
GCboxGGGCGGSP-1105,000~20bp
CAATboxGGCCAATCTCTF/NF160,000~22bp
②組織特異性轉錄因子:與基因表達的組織特異性有很大關係,能識別增強子或沉默子的轉錄調節因子。
③誘導性反式作用因子:活性能被特異的誘導因子所誘導,不需要通過DNA-蛋白質相互作用就參與轉錄調控的共調解因子。