“蛋白質”的二級結構蘊含著蛋白一級序列的生物信息,是三級結構,四級結構(亞基)的結構基礎,常見的二級結構有a螺旋,b摺疊,b轉角,loop無規線團等等,二級結構是功能發揮的基礎。
兩種主要類型的β-轉角
β-轉角(β-turn)是種簡單的非重複性結構。β轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的
氨基酸殘基。已經發現的蛋白質的抗體識別、
磷酸化、
糖基化和
羥基化位點經常出現在轉角和緊靠轉交。在β-轉角中第一個殘基的C=O與第四個殘基的N-H氫鍵鍵合形成一個緊密的環,使β-轉角成為比較穩定的結構,多處在
蛋白質分子的表面,在這裡改變
多肽鏈方向的阻力比較小。β-轉角的特定構象在一定程度上取決與他的組成
氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和
甘氨酸經常存在其中,由於甘氨酸缺少側鏈(只有一個H),在β-轉角中能很好的調整其他殘基的空間阻礙,因此使
立體化學上最合適的氨基酸;而脯氨酸具有換裝結構和固定的角,因此在一定程度上迫使β-轉角形成,促使多台自身回折且這些回折有助於反平行β摺疊片的形成。
β轉角也稱β彎曲、β回折、緊密轉角和髮夾結構。這種結構是伸展的
肽鏈形成180°的U型回折。
RNase的某些二級結構