轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉運RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的集合。
轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進行親和純化的
RNA聚合酶II轉錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。
相對於傳統的
晶元雜交平台,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化信號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍,是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
轉錄組測序技術是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等用
高通量測序技術把它們的序列測出來。全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態下的幾乎所有
轉錄本。反映出它們的表達水平。基因表達譜指通過構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性
cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的
基因表達種類和
丰度信息,這樣編製成的數據表就稱為基因表達譜。