絲氨酸蛋白酶
哺乳動物體內的消化蛋白酶
絲氨酸蛋白酶是一個蛋白酶家族，它們的作用是斷裂大分子蛋白質中的肽鍵，使之成為小分子蛋白質。在哺乳類動物裡面，絲氨酸蛋白酶扮演著很重要的角色，特別是在消化，凝血和補體系統方面。其激活是通過活性中心一組氨基酸殘基變化實現的，它們之中一定有一個是絲氨酸（其名字的由來）。在哺乳類動物裡面，絲氨酸蛋白酶扮演著很重要的角色，特別是在消化，凝血和補體系統方面。
胰分泌的酶裡面有三種是絲氨酸蛋白酶：
糜蛋白酶，又稱為胰凝乳蛋白酶，水解酶類的一種肽鏈內切酶，主要促使疏水性氨基酸尤其是酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端多肽裂解。由胰以糜蛋白酶原的形式分泌，在小腸內經胰蛋白酶作用而激活。糜蛋白酶A及B分子大小不同，但特異性則相似。
胰蛋白酶屬水解酶類，促使肽鏈分裂，作用部位為精氨酸或賴氨酸羧基。此酶以酶原形式由胰釋出，在小腸中轉化為活性形式。
絲氨酸蛋白酶
幾種激活的凝血因子都是絲氨酸蛋白酶，包括：
凝血因子
凝血第十一因子(XI)，即是血漿凝血酶活酶前質：作用於內源性凝血途徑的一種穩定因子。缺乏這種因子會引起系統性血凝缺陷，即C型血友病或Rosenthal綜合征，與典型血友病相似。
纖維蛋白溶酶，胞漿素，：是溶解纖維蛋白或血凝塊系統的有效部分，是對纖維蛋白有高度特異性的蛋白分解酶，對已經形成的纖維蛋白凝塊有特別的溶解力，對其他血漿蛋白、凝固因子和一般蛋白質也有類似作用。
補體系統裡面有幾種蛋白質屬於絲氨酸蛋白酶，包括：
C1r 和 C1s
C3轉化酶裂解補體成分C3為C3a和C3b的酶；經典途徑C3轉化酶是C4b，2b；旁路C3轉化酶是C3b，Bb和C3b，Bb。詳見：補體系統
通過鄰近的氨基酸殘基鏈，絲氨酸殘基在活性中心被激活。
被激活的羥基與肽鍵的碳原子發生親核反應。
肽鍵斷裂后，醯基上的碳被酯化，肽鍵的氮端會被釋放遊離。
水解反應，與酶相連的碳端產物被釋放。反應完成。
