楊坤

楊坤，工學博士，四川大學化工學院副教授，製藥與生物工程系工作。具有超過十年的生物工程相關領域的研究經驗；研究興趣廣泛，涉及生物分離、功能磁性微粒的製備及應用、環境微生物及微生物生態等多個領域；在Journal Chromatography A，Biochemical Engineering Journal，Separation and Purification Technology，Chemical Engineering Science，Industrial & Engineering Chemistry Research，Journal of Biotechnology，Analytical Biochemistry， Applied and Environmental Microbiology，Journal of Applied Microbiology等國際知名的學術期刊上發表SCI論文15篇，他引總次數超過150次。

學士：生物工程專業，天津大學，2001年；

博士：（碩博連讀），生物工程專業，天津大學，2007 年。博士論文題目：《蛋白質離子交換色譜的吸附傳質動力學研究》。

2007年9月-2008年4月：助理教授，廈門大學化學化工學院，化學工程與生物工程系

2008年5月-2011年6月：博士后，夏威夷大學馬諾亞分校，分子生物科學與生物工程系（Department of Molecular Biosciences & Bioengineering, University of Hawai'i at Manoa）

2011年7月-2013年5月：博士后，夏威夷大學馬諾亞分校，市政與環境工程系（Department of Civil and Environmental Engineering,University of Hawaii at Manoa）

2013年11月至今：副教授，四川大學化學工程學院，製藥與生物工程系

1. 生物分離：色譜分離過程的動力學研究；

2. 功能磁性微粒及相關應用：磁分離、多酶固定化、醫學診斷、磁性免疫分析等；

3. 環境微生物及微生物生態：環境致病菌的高靈敏度檢測、污水抗生素抗藥組、抗生素土壤環境效應等。

參研及主研項目

2004年9月-2007年5月

1、共聚焦激光掃描顯微鏡輔助多組分蛋白質吸附和色譜機理研究，國家自然科學基金；

2、蛋白質靜電吸附的多尺度研究，高等學校博士學科點專項科研基金；

3、蛋白質離子交換吸附平衡的多尺度方法學研究，國家自然科學基金；

2008年5月-2011年6月

1、環境中Ralstoniasolanacearum菌株集成化快速檢出系統的開發，美國農業部NRI支助；（Development of an integrated rapid detection system for discrimination of Ralstoniasolanacearum strains in the environment. No: 2005-55605-16683, USDA NRI grant, 2006-2011.）

2、一種高效生產植物源抗體的集成化方法，美國農業部TSTAR研究項目；（An Integrated Approach for Efficient Production of Plant-derived Antibodies.）

3、金屬螯合磁性納米顆粒的製備及應用；

4、自主裝的功能磁性納米油體。

2011年7月至今

1、市政污水中大腸桿菌致病基因的丰度及多態性；（Abundance and diversity for E. coli virulence genes in municipal wastewater.)

2、人為因素暴露下土壤抗生素抗性的分子演化，美（國）-以（色列）兩國科學基金會（項目）；（Molecular evolution of antibiotic resistance in soil exposed to anthropogenic factors. United States-Israel Binational Science Foundation）

3、夏威夷海灘沙中糞便指示菌及水生致病菌的存活，美國夏威夷衛生署（項目）；（Survival of Fecal Indicator Bacteria and Waterborne Pathogens in Hawaiian Beach Sand. Hawaii Department of Health）

主持項目

市政污水抗生素抗藥組研究，YJ201355,四川大學引進人才科研啟動經費資助項目，2014-2016。

Enzyme and Microbial Technology，Journal of Molecular Catalysis B

1. Yang K., Shi Q.and Sun Y. (2006) Modeling and simulation of protein uptake in cation exchanger visualized by confocal laser scanning microscopy. Journal Chromatography A. 1136, 19-28

2. Yang K.and Sun Y. (2007) Structured parallel diffusion model for intraparticle mass transport of proteins to porous adsorbent. Biochemical Engineering Journal. 37, 298-310

3. Lu M., BaiS., Yang K.and Sun Y. (2007) Synthesis and characterization of magnetic polymer microspheres with a core–shell structure. ChinaParticuology. 5, 180-185

4. Yang K.and Sun Y. (2008) Optics-intrinsic double-circle phenomenon in protein adsorption visualized by confocal laser scanning microscopy. Biochemical Engineering Journal. 39, 258–266

5. SunY.and　Yang K. (2008) Analysis of mass transport models based on the Maxwell-Stefan theory and the Fick’s law for protein uptake to porous anion exchanger. Separation and Purification Technology. 60, 180–189

6. Yang K., Bai S.and Sun Y. (2008) Protein adsorption dynamics in cation-exchange chromatography quantitatively studied by confocal laser scanning microscopy. Chemical Engineering Science. 63, 4045 – 4054

7. Huang J. L., Lin L.Q., Li Q.B., Sun D.H., Wang Y.P., Lu Y.H., He N., Yang K., Yang X., Wang H.X., Wang W.T. and Lin W.S. (2008) Continuous-flow biosynthesis of silver nanoparticles by lixivium of sundried Cinnamomumcamphora leaf in tubular microreactors. Industrial & Engineering Chemistry Research. 47, 6081-6090

8. Fan H. Y., Yang K., Zhang C. X., Wang X., He N., Wang Y. P., Sun D. H. and Li Q. B. (2008) Separation and purification of catalpol from Radix Rehmanniae. Journal of Chemical Industry and Engineering (China). 59(9), 2283-2288 (in Chinese with English abstract)

9. Wang X., Yang K., Wang Z. S., He N., Wang Y. P., Sun D. H. and Li Q. B. (2009) Separation and purification of flavonoids from CinnamomumCamphora leaves via microwave-assisted extraction and macroporous resin adsorption. Transactions of the CSAE. 25(Supp. 1): 138-141 (in Chinese with English abstract)

10. Wang H. T., Li Q.B., He N., Wang Y.P., Sun D.H., Shao W.Y., Yang K. and Lu Y.H. (2009) Removal of anthraquinone reactive dye from wastewater by batch hydrolytic-aerobic recycling process. Separation and Purification Technology. 67, 180-186

11. Yang K., Xu N. S. and Su W. W. (2010)Co-immobilized enzymes in magnetic chitosan beads for improved hydrolysis of macromolecular substrates under a time-varying magnetic field. Journal of Biotechnology. 148, 119-127

12. Yang K.and Su W. (2011) Facile synthesis of metal-chelating magnetic nanoparticles by exploiting organophosphorus coupling. Analytical Biochemistry. 408, 175-177

13. Yang K., Jenkins D. M. and Su W. W. (2011) Rapid concentration of bacteria using submicron magnetic anion exchangers for improving PCR-based multiplex pathogen detection. Journal of Microbiological Methods. 86, 69-77

14. Cui H.*, Yang K.*, Pagaling E. and Yan T. (2013). Spatial and Temporal Variations of Enterococci Abundance and Its Relationship with Microbial Community in Hawai’i Beach Sand and Water. Applied and Environmental Microbiology.79, 3601-3609(*equal contributors)

15. Yang K., Pagaling E. and Yan T. (2014) Estimating the Prevalence of Potential Enteropathogenic Escherichia coli and Intimin Gene Diversity in Bacterial Communities by Monitoring Sanitary Sewage. Applied and Environmental Microbiology, 80, 119-127

16. Pagaling E., Yang K. and Yan T. (2014) Pyrosequencing reveals correlations between extremelyacidophilic bacterial communities with hydrogen sulfide concentrations, pH and inert polymer coatings at concrete sewer crown surfaces.Journal of Applied Microbiology, 117, 50-64

1. Yang K., Yang Z., Shi Q.H. and Sun Y. Visualizing distribution of protein in chromatographic adsorbent beads using confocal laser scanning microscopy. Proceedings of the 1st National Annual Conference on Chemical Engineering and Biochemical Engineering, Nanjing, 2004; C066. (Oral presentation)

2. Yang K., Yang Z., Shi Q.H. and Sun Y. Protein diffusion behavior in porous medium visualized by confocal laser scanning microscopy. Nationwide Doctoral Forum of Chemical Engineering in China, Tianjin University, 2005; 190. (Oral presentation)

3. Yang K., Pagaling E., Li Y. and Yan T. Abundance and diversity of Escherichia coliintimin gene (eaeA) in Honolulu municipal wastewater. Hawaii Water Environment Association (HWEA) Annual Conference, 2013. (Poster presentation)

4. Yang K., Cui H., Pagaling E., and Yan T. Spatial and temporal variations of enterococci abundance and its relationship with microbialcommunity in Hawai’i beach sand and water. Hawaii Water Environment Association (HWEA) Annual Conference, 2013. (Poster presentation)

5. PagalingE., Yang K., and Yan T.Microbes involved in concrete sewer pipe corrosion. Hawaii Water Environment Association (HWEA) Annual Conference, 2013. (Poster presentation)

1. 數學物理方程（研究生課程），廈門大學，2008

2. 環境生物技術（本科生課程），四川大學，2014年春起

3. 代謝工程（本科生課程），四川大學，2014年春起