ISSR標記

該技術以錨定的微衛星DNA為引物，在SSR序列的3’或5’端加錨2．4個隨機核苷酸，在PCR反應中，錨定引物可以引起特定位點退火，導致與錨定引物互補的間隔不太大的重複序列間DNA片斷進行PCR擴增。所擴增的Inter．SSR區域的多個條帶可通過聚丙烯醯胺凝膠電泳或者瓊脂糖凝膠電泳得以分辨(周延清，2005)。它結合RAPD標記技術冪HSSR標記技術的優點，能夠提供更多的基因組DNA信息。現己廣泛應用於藥用植物種質資源鑒定、進化與親緣關係分析、遺傳多樣性與居群遺傳結構檢測、遺傳作圖、基因定位、分子標記輔助育種等方面的研究。

ISSR標記技術試驗操作簡單、快速、高效，不需要繁瑣的構建基因文庫、雜交和同位素顯示等步驟；重複序列和錨定鹼基的選擇是隨機的，無需知道任何靶標序列的SSR背景信息，從而降低了技術難度和實驗成本；無需活材料，無組織器官特異性，能實現全基因組無編碼取樣：採用了較長的引物(17。24bp)，退火溫度較高，因此，引物具有更強的專一性，增強了實驗可重複性。ISSR標記的缺點就是，在PCR擴增時需要一定時間摸索最適反應條件；呈顯性遺傳標記，不能區分顯性純合基因型和雜合基因型。