中國藥用及包括試驗有藥效的大型真菌有500餘種，除了傳統藥用的茯苓、冬蟲夏草、靈芝外，近些年新發現並作為藥用的有雲芝、樹花、古尼蟲草等，以及假蜜環菌、安絡小皮傘、槐栓菌、乳白耙菌、黑柄炭角菌等等。
藥用部分主要是子實體，但有一些是通過現代發酵工業技術大量反制菌絲體來加工製藥。國內外研究試驗表明，天然的
藥用真菌具有其獨特的優越性。在尋找治療高血壓、
高血脂、
糖尿病等現代文明病的藥物方面，從包括真菌在內的中藥中篩選，無疑是前景看好的。
常見種類有：
竹黃、古尼蟲草、冬蟲夏草、茯苓、雲芝、靈芝、鱗皮扇菇、
樹舌靈芝、糞生黑蛋巢菌、尖頂地星、
黃裙竹蓀、裂褶菌、灰包菇、頭狀禿馬勃、大禿馬勃、梨形馬勃、白鱗馬勃、
桑黃。
