山東省生物信息工程技術研究中心

山東省生物信息工程技術研究中心，2001年2月由山東省科技廳批准成立，是山東省唯一專門從事生物信息學和計算生物學研究的科研機構。研究中心主任由著名數學家、中國科學院院士萬哲先教授擔任；學術委員會主任為著名理論生物學家、中國科學院院士張春霆教授。

研究中心總面積800平方米，現有固定研究人員6人、兼職研究人員2人、研究生10餘人。中心包含兩個主要研究方向：生物信息學方向：主要藉助成熟的演演算法並結合自己編製的軟體進行基因、蛋白資料庫構建、DNA序列分析、蛋白質結構預測、創新藥物靶點篩選、分子進化和生物分子網路行為的計算機模擬等方面的工作；

計算生物化學方向：主要藉助量子化學計算、分子動力學模擬及分子對接等計算化學、計算生物學技術，研究生命起源與進化過程中的基本化學問題，探討蛋白質及各種藥物小分子的結構－功能關係並進行創新藥物的設計與虛擬篩選。

作為研究與開發的基礎，本中心還包含兩個技術支撐實驗室：

應用微生物學實驗室：主要任務是採集、分離、鑒定新菌株，研究各種真菌、細菌的發酵方法，評價殺菌劑的毒理、毒力，探討微生物次生代謝產物的合成機理；

天然產物化學實驗室：主要任務是研究各種小分子生物活性物質的分離提取方法，並測定其結構，進行結構修飾及物化特性分析。

本中心的核心目標是從理論和實驗兩方面揭示生命的起源、進化及生理、病理過程的分子機制，並在此基礎上獲得在醫藥、農業、化工、食品等領域具有核心競爭力的生物技術。

目前中心的科研工作主要集中於以下幾個課題： 1 生命起源與進化過程中的基本問題

本課題的主要目的是解答生命起源與進化過程的確定性問題，即如果生命重新起源一次，他們是否具有與現在的生命相似的組成和結構？本課題的研究在氨基酸、蛋白質、核酸及它們組成的複雜網路等各個層次上展開，所用的手段主要有量子化學計算、生物信息學分析及複雜系統行為的計算機模擬。此外，本課題也涉及手性起源、生物大規模滅絕等熱點問題。

2 生物活性分子的結構－功能關係

本課題的主要目的是通過闡明生物活性分子的結構－功能關係，為解釋生命現象、合理設計藥物奠定理論基礎。本課題的研究集中於蛋白質錯誤摺疊、聚集機理、金屬離子與自由基在該過程中的作用等方面，所用的手段主要有量子化學計算、分子動力學模擬、生物信息學建模與分析及各種波譜方法。本課題也涉及抗氧化劑、光敏劑、酶抑製劑等小分子的結構－功能關係。

3 計算機輔助藥物設計

本課題的主要目的是在掌握生物活性分子結構－功能關係的基礎上，進行合理藥物設計。本課題的研究集中於神經退行性疾病的藥物設計，所用的手段主要有量子化學計算、分子動力學模擬、分子對接及生物信息學建模與分析。本課題也涉及其他藥物及農藥的合理設計。

本中心目前是山東理工大學重點建設的科研機構之一。我們將堅持"發揮優勢、突出特色、勇於創新、重視轉化"的方針，努力把自己建設成開放、流動、有國際影響的學術團體，爭取儘快成為生物化學、生物物理學、化學生物學方面的國家級科研機構。