蛋白磷酸酶是具有催化已經磷酸化的蛋白質分子發生去磷酸化反應的一類酶分子，與蛋白激酶相對應存在，共同構成了磷酸化和去磷酸化這一重要的蛋白質活性的開關係統。
蛋白磷酸酶的作用和蛋白激酶相反。根據脫磷酸化的
氨基酸殘基的不同，蛋白磷酸酶也分成蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP，PTPase)和
絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶。
①CD45：該分子胞內段的兩個結構域發揮
PTP的作用，因而
CD45屬於受體型
蛋白酪氨酸磷酸酶，在對抗瓢kPTK的作用和啟動淋巴細胞信號轉導中發揮關鍵作用；
②鈣調磷酸酶(calcineurin)屬絲/蘇氨酸磷酸酶，其底物是
轉錄因子NF-AT分子已發生磷酸化的
絲氨酸和
蘇氨酸殘基。在鈣調磷酸酶的作用下，NF-ATp因脫去
磷酸根(p)而激活，成為活化的轉錄因子NF-AT。
