SSR檢測

微衛星位點通常通過PCR擴增和電泳檢測，並根據片段大小分離等位基因進行分析；擴增后的等位微衛星可以用多種方法檢測，傳統方法採用聚丙烯醯胺凝膠電泳加放射顯影或銀染的方法，費時費力效率低。閱微基因基於5年的經驗，利用ABI遺傳分析儀對熒游標記的DNA片段進行檢測，結合分子量內標進行DNA片段長度計算，使STR分型變得高效快捷，結果也更加精確。

1．SSR引物開發

通過富集微衛星序列，開發出20-30條具有一定重複特徵的微衛星序列，並且對序列進行多態性和特異性驗證。

2．引物篩選

選取部分代表性樣本，利用普通引物進行PCR擴增，然後利用高解析度晶元電泳或PAGE驗證引物的特異性、擴增效率和基因座多態性等信息。

3．樣本批量擴增

用帶有熒游標記（FAM/HEX/TMR/ROX等）的引物，對批量樣本進行PCR擴增。我公司擁有高通量PCR儀平台，可以滿足大量樣本擴增需求。

4．測序儀檢測

帶有熒游標記的PCR產物進行稀釋后與分子量內標混合，用3730xl等測序儀進行毛細管電泳，並得到原始數據。 5．原始數據分析

編製panel和bin等文件，使用正版GeneMapper v4.0軟體分析測序儀得到的fsa文件，並生成PDF圖譜和Excel文檔（包括size、基因分型等信息），分析后的電泳圖譜。

6．群體遺傳學分析

利用生物信息學軟體（POPGENE、MEGA、PHYLIP、ARLEQUIN等）對上述數據進行進一步分析，繪製遺傳連鎖圖譜、分析連鎖不平衡和分析多態性等。

細胞（≥10）、組織（≥300mg）、血液（≥1ml）、基因組DNA（≥20μl，濃度≥ 50ng/μl）；引物信息、片段長度範圍、瓊脂糖電泳圖等。

引物、微衛星分析的原始數據以及GeneMapper生成的PDF圖譜、包含片段長度等信息的Excel文檔和進一步的分析結果等。

到目前為止，閱微基因與上百家科研機構建立合作，進行過多個物種的引物開發、多態性分析、種系鑒定和連鎖圖譜構建等工作，包括人、小鼠、大鼠、兔、馬、犬、牛、大熊貓、魚、蝦、麻雀、蜜蜂、蚊子、蚜蟲、瓢蟲、小麥、玉米、大豆、棉花、楊樹、蘋果、葡萄和真菌等。