生物性污染物

微大腸桿菌群密度作為指標，大腸桿菌群不代表某一個或某一屬細菌，指的是一群具有某些特性的細菌。大腸桿菌群分佈範圍廣，同時存活在環境、人體與動物的消化道中，且在環境中存活能力較強；大部分的大腸桿菌群是無害的，但如果這些細菌出現在飲用水中，並且超過管制標準，代表水中可能有病原菌，尤其老人、嬰兒免疫系統差，就可能會造成健康上的危害，因此大腸桿菌群常被用為飲用水水質安全之指標微生物。由於其在水中廣泛存在且存活性較一般病菌高，因此當水中檢測出大腸桿菌群時，即必須注意是否有其他致病微生物之存在。受糞便污染之水樣中，多以典型大腸桿菌（E.Coli）為主，而外界環境中則以大腸桿菌群其他型別較多。

菌落則存檢細菌，檢菌落未必致病微，故般僅消毒效率評估指標，據評斷質。致病細菌包括退伍菌、霍亂弧菌、沙門氏菌及痢疾桿菌等，尤其痢疾桿菌曾多次在校園中引起群聚感染。沙門氏桿菌會造成幼兒腸胃道疾病，是常見的致病菌，一年四季皆可流行，好發於每年的7月～10月炎熱季節，因天氣潮溼酷熱，而給予沙門氏菌繁殖的最佳機會。其傳染途徑是經由糞口傳染，原因為食用遭污染的水或食物製品。一般在食用遭沙門氏菌污染的食物或飲水后，約6～72小時發生腸胃炎癥狀，如噁心、嘔吐、下痢等，預防方式主要為接觸食物與飲水前後勤洗手、水塔固定時間清洗消毒、食物與飲水煮熟煮沸后食用等。

霍亂猝急細菌腸炎，霍亂弧菌染引，癥狀痛量米湯腹瀉，偶伴嘔吐、速脫、酸中毒和循環衰竭。台灣自1962年後積極辦理霍亂防治措施，除偶有境外移入病例外，本土病例至今多屬散發病例，僅發生少數群聚事件，惟1997-2000年間陸續有8例本土病例因生食受污染的甲魚卵或因處理生甲魚時不慎污染其他食材，而感染霍亂弧菌，生食受霍亂弧菌污染海域捕獲的海鮮，亦曾導致數次爆發流行。霍亂弧菌可在污水中存活相當長的時間，故感染霍亂原因為食入受霍亂弧菌污染的水或食物。霍亂弧菌不耐熱，故水產魚、貝類經充分煮熟，飲用水要充分煮沸，即可殺死霍亂弧菌。退伍軍人菌普遍存在於各類水體環境中，而且熱水供應系統、空調之冷卻水塔、蒸氣凝結設備均曾發現退伍軍人菌。退伍軍人菌可能會引起退伍軍人症及龐提亞克熱，主要傳染途徑是經飛沫傳染，即由空氣中之小氣泡顆粒傳播。亦可經由吸入嗆入受污染之水而致病。

原生動物則以梨形鞭毛蟲、隱孢子蟲為代表，其所導致之水媒病事件以1993年美國威斯康辛州密爾瓦基市之隱孢子蟲事件最為著名，共造成40萬人感染，4,000人住院以及100人死亡，主要原因是水處理異常所導致。由於加氯消毒對隱孢子蟲去除效率不佳，適當過濾程序為較有效之去除辦法。另外當水中某些藻類因優養化而大量滋生時，藻類毒素的產生對飲用水水質安全所產生之威脅亦值得注意。