出身仕宦之家，其父孫詒經光緒時任戶部左侍郎，岳父李瀚章任兩廣總督，兄孫寶琦晚清時出任駐法、駐德公使、順天府尹，民國時任國務總理。
寶瑄曾先後任工部、
郵傳部、
大理院等職。雖然功名不顯，但是學問涉獵甚廣，交友也一時俊傑，諸如
章太炎、
梁啟超、
譚嗣同、
汪康年、
夏曾佑、
張元濟、
嚴復，完全可以設想其見聞之廣博。孫家是書香門第，據其日記中說藏書不下二萬卷，“凡經史子集著名之書幾備"，所以他能夠"頻年坐擁書城"。
孫書讀得好，能文能詩，兼擅書法，也曾想有一番作為。可是終於在仕途上很不得意，他在日記中流露了一點含蓄的牢騷：”余昔嘗有從容廊廟端委垂紳之志，今則惟知一丘一壑，蕭條方外而已。"為什麼這樣呢？他的一位好友說，是他"太不精於宦學"。確實如此。孫有《忘山廬日記》、《忘山廬詩存》傳世。
