真核生物域

真核生物是所有單細胞或多細胞的、其細胞具有細胞核的生物的總稱。包括所有多細胞生物——原生生物、動物、植物、真菌，以及一些單細胞的原生生物。

這些生物的共同點是它們的細胞內含有細胞核以及其它細胞器。此外它們的細胞具有細胞骨架來維持其形狀和大小。所有的真核生物都是從一個類似於細胞核的細胞（胚胎、孢子等）發育出來的。其它細胞中沒有細胞核的生物被通稱為原核生物。

真核生物的另一個特點是它們的細胞在製造蛋白質時可以用同一段基因製造不同的蛋白質。這個功能在術語中被稱為選擇性剪接。

分類學家傾向將生物分為三域系統（tree domains system），域是比 界還高的分類系統，其中真核生物域一般又分為四界：原生生物界、真菌界、植物界、動物界。

例如：現代人類屬於真核生物域—→動物界—→脊索動物門—→脊椎動物亞門—→哺乳綱—→真獸亞綱—→靈長目—→人科—→人屬—→智人種。

藻類（Algae）

綠藻門（Chlorphyta）

不等鞭毛藻門（Heterokontae）

矽藻門（Bacillariphyta）

褐藻門（Phaeophyta）

紅藻門（Rhodophyta）

藍藻門（Cyanophyta）

菌類（Fungi）

細菌門（Bacteria）

黏菌門（Myxomycophyta）

真菌門（Eumycophyta）

在古時候，人們就已認識到動物和植物應分為兩類。在林奈建立分類階元時，雖然存在一定疑惑但還是把真菌劃為兩界說中的植物界。而後來的學者把真菌獨立成一界，即把真核生物分為四界：原生生物界、植物界、動物界、真菌界。顯微鏡發明后，所發現的許多原生生物根據是自養還是異養，劃分為原生植物與原生動物，分別歸入植物界與動物界。而海克爾增加了原生生物界，即把真核生物分為四界。

在20世紀80年代之前，單細胞的原生生物的分類還處於很混亂的階段，直到DNA測序技術的成熟使系統發生學出現，改變了這一狀況，也使人們開始重新譜寫真核生物的分類。

根據系統發生學的研究，根據進化分支上的同源性，2005年的國際原生生物學家協會提出了一種在當時被普遍接受的真核生物分類方法，分作六類（supergroups）。這種分類方法並沒有明確這些類是生物分類學上的哪一等級，但其它文獻將其當作“界”。

但是，這一“六界說”很快就遭到了新的研究的挑戰，特別是對囊泡藻界是否有共同起源的質疑。真核生物的分類目前仍有很大的不確定性。例如，把真核生物分為單鞭毛生物（Unikonta）與雙鞭毛生物（Bikonta），前者包括變形蟲界與后鞭毛生物，後者其它四界。但是，很多研究表明單鞭毛生物與雙鞭毛生物都不是同源的進化支。另外，有孔蟲界應該併入囊泡藻界。泛植物界也應該不是同源的，需要被細分。

真核細胞與原核細胞的主要區別是：

1　真核細胞具有由染色體、核仁、核液、雙層核膜等構成的細胞核；原核細胞無核膜、核仁，故無真正的細胞核，僅有由核酸集中組成的擬核。

2　真核細胞的轉錄在細胞核中進行，蛋白質的合成在細胞質中進行，而原核細胞的轉錄與蛋白質的合成交聯在一起進行。

3　真核細胞有內質網、高爾基體、溶酶體、液泡等細胞器，原核細胞沒有。

4　真核生物中除某些低等類群（如甲藻等）的細胞以外，染色體上都有5種或4種組蛋白與DNA結合，形成核小體；而在原核生物則無。

5　真核細胞在細胞周期中有專門的DNA複製期（S期）；原核細胞則沒有，其DNA複製常是連續進行的。

6　真核細胞的有絲分裂是原核細胞所沒有的。

7　真核細胞有發達的微管系統，其鞭毛（纖毛）、中心粒、紡錘體等都與微管有關，原核細胞則否。

8　真核細胞有由肌動、肌球蛋白等構成的微纖維繫統，後者與胞質環流、吞噬作用等密切相關；而原核生物卻沒有這種系統，因而也沒有胞質環流和吞噬作用。

9　真核細胞的核糖體為80S型，原核生物的為70S型，兩者在化學組成和形態結構上都有明顯的區別。

10　真核細胞含有的線粒體，為雙層被膜所包裹，有自己特有的基因組、核酸合成系統與蛋白質合成系統，其內膜上有與氧化磷酸化相關的電子傳遞鏈。

11　原核細胞功能上與線粒體相當的結構是質膜和由質膜內褶形成的結構，但後者既沒有自己特有的基因組，也沒有自己特有的合成系統。真核生物的植物含有葉綠體，它們亦為雙層膜所包裹，也有自己特有的基因組和合成系統。與光合磷酸化相關的電子傳遞系統位於由葉綠體的內膜內褶形成的片層上。原核生物中的藍細菌和光合細菌，雖然也具有進行光合作用的膜結構，稱之為類囊體，散佈於細胞質中，未被雙層膜包裹，不形成葉綠體。

最原始的真核生物的直接祖先很可能是一種異常巨大的原核生物，體內具有由質膜內褶而成的象內質網那樣的內膜系統和原始的微纖維繫統，能夠作變形運動和吞噬。以後內膜系統的一部分包圍了染色質，於是就形成了最原始的細胞核。內膜系統的其他部分則分別發展為高爾基體、溶酶體等細 胞器。按照美國學者L.馬古利斯等重新提出的“內共生說”（見細胞起源），線粒體起源於胞內共生的能進行氧化磷酸化的真細菌，而葉綠體則起源於胞內共生的能進行光合作用的藍細菌。

美國學者R.W.惠特克1969年把真核生物分為 5界即：原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和動物界。原生生物界包括原生動物、單細胞藻類和單細胞真菌。真菌界營腐生或寄生生活，多數種類細胞有幾丁質的壁，菌體多由菌絲組成。植物界有葉綠體，能進行光合作用，細胞有纖維素的壁。動物界有攝食或捕食生活，多數種類能運動，細胞無壁，有複雜的胚胎髮育過程。這種分法現在已經得到了較普遍的承認。