楊澤峰

揚州大學農學院教授、博士生導師

楊澤峰:山東濱州人,男,1977年7月出生,揚州大學農學院教授,博士生導師。江蘇省傑出青年基金獲得者,入選揚州大學高端人才支持計劃。

個人簡介


男,1977年7月出生,山東陽信縣人,中共黨員,揚州大學農學院作物遺傳育種與應用生物技術系副主任,教授、博士生導師,青島農業大學客座教授。江蘇省傑出青年基金獲得者(2015),江蘇省優秀博士學位論文獲得者(2009),入選揚州大學高端人才支持計劃(拔尖人才成長計劃,2014),揚州大學科技先鋒(2015)。
2000年畢業於山東萊陽農學院,獲農學學士學位;2003年6月畢業於揚州大學作物遺傳育種專業,獲農學碩士並留校任教。2008年6月畢業於揚州大學作物遺傳育種專業,獲農學博士學位。2009年和2014年先後2次赴美國East Carolina大學(黃錦嶺教授實驗室)開展博士后和訪問學者研究。
從事本科生《生物統計與試驗設計(國家精品資源共享課)》和《常用統計分析軟體的應用》,研究生《數據分析與軟體應用》等課程的教學工作;主編《SPSS農業試驗數據分析實用教程》教材1部,參編《生物信息學》和《生物統計與試驗設計》教材2部;曾獲揚州大學優秀課堂教學質量一等獎、揚州大學優秀教學成果獎二等獎等。
從事作物分子進化和玉米功能基因組學的研究工作,主持國家自然科學基金、973項目子課題、江蘇省自然科學基金、江蘇省高校自然科學研究重大項目等多項研究工作;在New Phytologist、Scientific Reports、Molecular Biology and Evolution等刊物發表SCI論文30餘篇;申請發明專利2項;獲得教育部自然科學二等獎1項。
2021年,揚州大學農學院楊澤峰教授作為團隊負責人的“農學專業核心課程教學團隊”入選“青藍工程”優秀教學團隊。

成就


主要研究進展:
(1)以進化基因組學分子生物學方法相結合,揭示了水平基因轉移等進化機制對陸生植物起源和進化的影響,並闡明了多個基因在農作物基因工程育種中的應用價值
在分子水平上對植物水平轉移等方式起源基因的系統進化分析,將為闡述植物特有形態特徵、代謝途徑和環境適應性具有重要的理論意義,並可為在作物遺傳改良的基因工程育種中加以應用提供借鑒。
在基因組水平上對陸生植物基因組中水平轉移方式起源基因進行了系統的鑒定,發現陸生植物基因組與維管束發育相關的TAL、AEE等基因、抗病相關Tm-1基因等起源和進化方式,闡明了陸生植物祖先物種通過水平轉移方式獲得這些基因及其對適應陸地生態環境的價值,進一步基於分子生物學等方法闡明了目的基因生物學功能,明確了其對於作物產量性狀遺傳改良中潛在基因工程育種的應用價值。
(2)建立了基於生物信息學對植物重要基因家族進行分子進化研究的技術體系,系統闡述了主要農作物產量和品質相關多個基因家族的分子進化規律
根據進化基因組學的原理和方法,結合生物信息學手段,探討一些植物重要基因家族的起源和分化及其功能意義,研究表型變異分子變異、基因組變異與環境變異之間的相關性和規律性,從染色體和基因組水平上闡明了這些基因家族對植物進化規律和機制和影響。系統闡釋了農作物產量和品質性狀相關的TLP、SBP-box、CPP-like、HAK、Soluble starch synthases、Hsf等基因家族的分子進化規律,闡明了基因重複等進化機制對目的基因家族的影響及與相關性狀的關聯。相關研究結果一方面為闡釋農作物產量、品質和抗逆性相關基因的分子進化機制提供了依據,另一方面為主要農作物遺傳改良中基因工程和分子設計育種提供借鑒。
(3)結合對目的基因分子進化和遺傳解析,對主要農作物多個產量和品質相關關鍵基因進行了功能鑒定和優異等位變異挖掘,為在分子設計育種中加以應用奠定了基礎
隨著越來越多植物全基因組測序的完成,農作物基因組研究的重點逐漸從基因的發現轉移到對基因功能的研究上來。利用轉基因方法和候選基因的關聯分析方法對多個基因的功能進行了遺傳解析,尤其是對玉米和水稻中一些與作物產量和品質相關的基因進行了功能鑒定,為進一步利用基因工程、分子標記輔助選擇等手段改良農作物產量和品質提供借鑒。基於圖位克隆和轉基因方法對水稻SLG7、OsABC1-2、LYL1等基因進行了功能鑒定,對揭示水稻產量形狀的遺傳基礎具有重要的理論價值,並對水稻產量性狀遺傳改良的基因工程育種具有重要的應用價值。
對玉米RTCS、Zfl1、Zfl2、ZmBT1、ZmISA2和ZmYS1等多個基因進行了系統分析,闡明了目的基因在我國玉米骨幹親本及衍生系中的傳遞規律;並進一步結合對產量和品質性狀的測定,闡明了目的基因序列變異對產量和品質性狀的影響,挖掘出目的基因中優異的等未變異,為進一步利用目的基因的優異變異開展分子設計育種奠定了基礎。
發表的主要論文:
Li P, Cao W, Fang H, Xu S, Yin S, Zhang Y, Lin D, Wang J, Chen Y, Xu C* and Yang Z*. Transcriptomic profiling of the maize (Zea mays L.) leaf response to abiotic stresses at the seedling stage. Frontiers in Plant Science, 2017, 8: 290.
Tao Y, Zhu J, Xu J, Wang L, Gu H, Zhou R, Yang Z, Zhou Y*, Liang G*. Exploitation of heterosis loci for yield and yield components in rice using chromosome segment substitution lines. Scientific Reports, 2016, 6: 36802.
Yang Z, Liu L, Fang H, Li P, Xu S, Cao W, Xu C*, Huang J*, Zhou Y*. Origin of the plant Tm-1-like gene via two independent horizontal transfer events and one gene fusion event. Scientific Reports, 2016, 6: 33691.
Zhou Y, Dong G, Tao Y, Chen C, Yang B, Wu Y, Yang Z, Liang G*, Wang B*, Wang Y*. Mapping Quantitative Trait Loci Associated with Toot Traits Using Sequencing-Based Genotyping Chromosome Segment Substitution Lines Derived from 9311 and Nipponbare in Rice (Oryza sativa L.). PLoS One. 2016, 11(3): e0151796.
Zhou Y, Miao J, Gu H, Peng X, Leburu M, Yuan F, Gu H, Gao Y, Tao Y, Zhu J, Gong Z, Yi C, Gu M, Yang Z*, Liang G*. Natural Variations in SLG7 Regulate Grain Shape in Rice. Genetics. 2015, 201(4): 1591-1599.
Yang Z#, Zhou Y#, Huang J, Hu Y, Zhang E, Xie Z, Ma S, Gao Y, Song S, Xu C*, Liang G*. Ancient horizontal transfer of transaldolase-like protein gene and its role in plant vascular development. New Phytologist 2015, 206(2):807-816.
Yang Z, Ma S, Hu Y, Zhang E, Xie Z, Xu S, Liu L, Deng L, Xu C*, Huang J*: Association Analysis of the Maize Gene ZmYS1 with Kernel Mineral Concentrations. Plant Molecular Biology Reporter 2015, 33(5):1327-1335.
Wang X, Yang Z, Xu C*: A comparison of genomic selection methods for breeding value prediction. Science Bulletin 2015, 60(10):925-935.
Gao Q, Zang H, Gao Y, Yang Z, Zhou Y, Luo Y, Yuan Y, Wang Y, Yang L, Xu Xet al: Comprehensive molecular evolution and gene expression analyses of the ABC1 atypical kinase family in rice and Arabidopsis. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 2015, 24(2):210-217.
Yin Z#, Zhang Z#, Deng D, Chao M, Gao Q, Wang Y, Yang Z, Bian Y, Hao D, Xu C*: Characterization of Rubisco Activase Genes in Maize: An alpha-Isoform Gene Functions alongside a beta-Isoform Gene. Plant Physiology 2014, 164(4):2096-2106.
Yang Z#, Zhang E#, Li J, Jiang Y, Wang Y, Hu Y, Xu C*: Analyses of sequence polymorphism and haplotype diversity of LEAFY genes revealed post-domestication selection in the Chinese elite maize inbred lines. Molecular Biology Reports 2014, 41(2):1117-1125.
Yang Z#, Zhang E#, Jiang Y, Xu S, Pan L, Chen Q, Xu C*: Sequence polymorphisms in Zmisa2 gene are significantly associated with starch pasting and gelatinization properties in maize (Zea mays L.). Molecular Breeding 2014, 34(4):1833-1842.
Yang Z#, Wang Y#, Gao Y, Zhou Y, Zhang E, Hu Y, Yuan Y, Liang G, Xu C*: Adaptive evolution and divergent expression of heat stress transcription factors in grasses. BMC Evolutionary Biology 2014, 14.
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Tang Z, Hu W, Huang J, Lu X, Yang Z, Lei S, Zhang Y, Xu C*: Potential Involvement of Maternal Cytoplasm in the Regulation of Flowering Time via Interaction with Nuclear Genes in Maize. Crop Science 2014, 54(2):544-553.
Zhou Y#, Gong Z#, Yang Z#, Yuan Y, Zhu J, Wang M, Yuan F, Wu S, Wang Z, Yi Cet al: Mutation of the Light-Induced Yellow Leaf 1 Gene, Which Encodes a Geranylgeranyl Reductase, Affects Chlorophyll Biosynthesis and Light Sensitivity in Rice. Plos One 2013, 8(9).
Zhang E, Yang Z*, Wang Y, Hu Y, Song X, Xu C*: Nucleotide Polymorphisms and Haplotype Diversity of RTCS Gene in China Elite Maize Inbred Lines. Plos One 2013, 8(2): e56495.
Yang Z, Wang Y, Zhou Y, Gao Q, Zhang E, Zhu L, Hu Y, Xu C*: Evolution of land plant genes encoding L-Ala-D/L-Glu epimerases (AEEs) via horizontal gene transfer and positive selection. BMC Plant Biology 2013, 13: 34.
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Tang Z, Yang Z, Hu Z, Zhang D, Lu X, Jia B, Deng D, Xu C*: Cytonuclear epistatic quantitative trait locus mapping for plant height and ear height in maize. Molecular Breeding2013, 31(1):1-14.
Tang Z, Hu Z, Yang Z, Yu B, Xu C*: Framework for dissection of complex cytonuclear epistasis by a two-dimensional genome scan. Chinese Science Bulletin 2012, 57(21):2675-2680.
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Yang Z#, Zhou Y#, Wang X, Gu S, Yu J, Liang G, Yan C, Xu C*: Genomewide comparative phylogenetic and molecular evolutionary analysis of tubby-like protein family in Arabidopsis, rice, and poplar. Genomics 2008, 92(4):246-253.
Yang Z, Wang X, Gu S, Hu Z, Xu H, Xu C*: Comparative study of SBP-box gene family in Arabidopsis and rice. Gene 2008, 407(1-2):1-11.
Yang Z, Gu S, Wang X, Li W, Tang Z, Xu C*: Molecular evolution of the CPP-like gene family in plants: Insights from comparative genomics of Arabidopsis and rice. Journal of Molecular Evolution 2008, 67(3):266-277.
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