細菌分類

在細菌的鑒別和分類中，對其細胞結構或是生理、生化特性進行觀察和測定並不太困難的，多利用下列方法：在各種培養基上的生長狀況；對碳水化合物和蛋白質的利用和分解情況；在DNA中的鳥嘌呤、胞嘧啶的克分子量的百分比；有時還根據血清學的試驗結果等。細菌的屬名和種名都是按命名規則而定的，但認為把全部細菌都按一個分類體系來定名不太合理的意見，愈來愈顯得有說服力。

（1）已往在應用上廣為依據的伯傑氏分類手冊第7版（1957年）中，在原生植物門中設置了包括裂殖菌綱、病毒和立克次氏體類的最小生物綱，並將裂殖菌綱分成10目：（i）假單胞菌目；（ii）鞘桿菌目；（iii）生絲微菌目；（iv）真桿菌目；（v）放線菌目；（vi）核衣細菌目；（vii）貝日阿托氏菌目；（viii）粘球菌目；（ix）螺旋體目；（x）支原體目。

（2）在該書第8版（1974年）中雖分作原核生物界的細菌門，但由於加強了該書的便覽性質，因而在其以下等級不再細分，只把全體分作19個部門，在各部門中，只在可能的情況下才把屬編成科和目。

（3）所謂細菌類，和其它的真核菌都是構成不同於植物界的另一個菌界（Mycota），從這樣的見解來看，作為原核菌類可放在亞界的位置上。然後，再像真核菌類的分類那樣，把原核菌類大致區分作枝原體類、細菌類、粘細菌類、螺旋體類和放線菌類5個門。其詳細區分可以應用伯傑氏分類法。在其中間不包括病毒類。

1、根據形狀分為三類，即：球菌、桿菌和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺桿菌）。

2、按細菌的生活方式來分類，分為兩大類：自養菌和異養菌，其中異養菌包括腐生菌和寄生菌。

3、按細菌對氧氣的需求來分類，可分為需氧（完全需氧和微需氧）和厭氧（不完全厭氧、有氧耐受和完全厭氧）細菌。

4、按細菌生存溫度分類，可分為喜冷、常溫和喜高溫三類。

細菌也對人類活動有很大的影響。一方面，細菌是許多疾病的病原體，可以通過各種方式，如接觸、消化道、呼吸道、昆蟲叮咬等在正常人體間傳播疾病，具有較強的傳染性，對社會危害極大。另一方面，人類也時常利用細菌，例如乳酪及酸奶和酒釀的製作、部分抗生素的製造、廢水的處理等，都與細菌有關。在生物科技領域中，細菌也有著廣泛的運用。

細菌對環境，人類和動物既有用處又有危害。一些細菌成為病原體，導致了破傷風、傷寒、肺炎、梅毒、霍亂和肺結核。在植物中，細菌會導致葉斑病、火疫病和萎蔫。感染方式包括接觸、空氣傳播、食物、水和帶菌微生物。病原體可以用抗菌素處理，抗菌素分為殺菌型和抑菌型。

細菌通常與酵母菌及其他種類的真菌一起用於醱酵食物，例如在醋的傳統製造過程中，就是利用空氣中的醋酸菌（Acetobacter）使酒轉變成醋。其他利用細菌製造的食品還有乳酪、泡菜、醬油、醋、酒、優格等。細菌也能夠分泌多種抗生素，例如鏈黴素即是由鏈黴菌（Steptomyces）所分泌的。

細菌能降解多種有機化合物的能力也常被用來清除污染，稱做生物復育（bioremediation）。舉例來說，科學家利用嗜甲烷菌（methanotroph）來分解美國喬治亞州的三氯乙烯和四氯乙烯污染。