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方向東
中科院北京基因組研究所研究員
方向東,中國科學院北京基因組研究所博士生導師,“百人計劃”研究員。
方向東[中國科學院北京基因組研究所研究員]
1995-1996年,第一軍醫大學分子免疫學研究所助教。
1997-2000年,中科院上海生物化學研究所(現上海上海生命科學研究院)訪問學者。
2000-2003年,美國華盛頓大學醫學院博士后。
2003-2007年,美國華盛頓大學醫學院講師。
2007-2009年,美國華盛頓大學醫學院助理教授。
2009年應聘為中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員。
學術兼職
2002 Sigma Xi, the Scientific Research Society
2003 American Association for the Advancement of Science (AAAS)
2004 American Society of Gene Therapy (ASGT)
2005 The Histochemical Society (HCS)
2009 中國遺傳學會 會員
2010 Associate Editors-in-Chief,Genomics Proteomics Bioinformatics
2011 《遺傳》 編委
2012 《發育醫學》(網路版) 副主編
2003年上海市科技進步三等獎(033101) 《重組基因工程藥物凝血因子VIII的研製與開發》
2000年廣東省科技進步二等獎(2000-J-2-R02-X058) 《重組蛋白質表達、復性、純化新工藝及人G-CSF新葯研製》
1998年 國家II類新葯證書((98)衛葯證字S-09) 《重組人粒細胞集落刺激因子(rhG-CSF)的研製》
1998年 中國人民解放軍科技進步三等獎(1998-3-93-3) 《IL-2/GM-CSF融合基因的構建,克隆及高效表達》
2004年 中國專利(CN 1361178) 《產生凝血因子VIII的生產方法和宿主細胞》
2002年 中國專利(CN 1334084) 《含吡咯並喹啉醌的治療鉛中毒的藥物組合物》
2001年 中國專利(CN 1324821) 《新的人促神經營養因子及其編碼序列,及製法和用途》
1998年 中國專利(CN 1169998) 《重組蛋白提取純化方法》
以人類珠蛋白的轉基因小鼠為模型,利用Real-Time PCR和新一代高通量測序為基礎的DNase I作圖、染色質免疫沉澱(ChIP)、染色體構象捕獲(3C)等表觀遺傳學技術,研究真核細胞中非基因編碼區的順式調控元件的作用機制。發現:1) Pol II、TBP、TFIIB等重要轉錄因子與真核基因啟動子區域內的順式調控元件的結合與真核基因的轉錄調控密切相關;同時,具有不同發育時期的特異性(Duan et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002;Fang et al. J. Biol. Chem., 2004;Li et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004;Li et al. Nucleic. Acids Res., 2006)。2) 位於珠蛋白基因上游15-25 kb的非基因編碼區 (Locus Control Region, LCR) 內的染色質組蛋白末端修飾狀態以及染色體結構等表觀遺傳學調控機制的變化,對於真核基因的轉錄調控具有重要的作用,且具有發育時相的特異性(Fang et al. Mol. Cell Biol, 2005;Fang et al. J. Mol. Biol., 2007;Yin W et al. Blood. 2007)。3) 參加DNA組分總匯計劃(ENCODE),以人類胚胎幹細胞及其紅系分化系統為模型,利用高通量的測序平台,研究真核基因在幹細胞分化過程中的表觀遺傳學調控機制。已經發現在人類基因組的非編碼區內存在著大量組織器官和發育時相特異性的調控序列,它們通過各種反式作用因子及其協同蛋白的相互作用,形成複雜、精細的網路調控系統。
主要研究領域
主要的研究方向是真核基因的表觀遺傳學調控。
研究內容包括:(1) 分析正常人和典型疾病患者的全基因組表觀遺傳學圖譜,在全基因組範圍內篩選新的順式調控元件和反式調控因子,確定它們的生物學功能和作用機制;(2) 研究真核基因在細胞發育和分化過程中的表觀遺傳學調控規律;(3) 探討染色質的組成與結構在真核基因轉錄調控中的作用機制。主要實驗技術包括染色質免疫沉澱技術(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP )、DNase I或小球核酸酶(micrococcal nuclease,MNase)作圖、染色體構象捕獲(chromosome conformation capture,3C)、以及高通量DNA測序技術(next-generation sequencing)等。
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·方向東,高基民,馬驪,周峻岭,黃樹其,刁志宏,陳澤洪,王小寧. 雙誘導模式原核表達系統的建立與應用。第一軍醫大學學報,1997; 17(4): 253-257
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·方向東,劉宏,周峻岭,黃樹其,陳淳,謝志偉,戚正武,王小寧. 牛鹼性成纖維細胞生長因子在酵母中表達產物的純化與鑒定. 第一軍醫大學學報,1996; 16(3): 198-201
·方向東,黃樹其,陳淳,耿解萍,謝志偉,王小寧,戚正武. 牛鹼性成纖維細胞生長因子cDNA的克隆及其酵母重組表達質粒的構建. 第一軍醫大學學報,1996; 16(2): 78-81
參編著作:
l方向東,王琪。染色質。見:陳淳、徐沁譯.高級分子生物學要義; 1版。原著:Twyman RM;北京:科學出版社,2000; 33-41
2、國家重大科學儀器設備開發專項分課題“高通量細胞分選多模式檢測儀器在血液幹細胞分化研究中的應用”;
3、國家“十二五”科技支撐計劃分課題“幹細胞用於血液系統惡性疾病診斷和治療的研究”;
4、國家“十二五”863計劃分課題“腫瘤的個體化RNA干擾治療”;