金馬地區

因國共內戰爆發，國民黨軍節節潰敗於中國人民解放軍。鑒於形勢，國民黨的“福建省政府”1949年8月隨國軍從福州市遷駐金門。朝鮮戰爭爆發后，解放軍曾多次進攻該地而未捷，而國軍亦無能力反攻。進而形成福建由兩政治實體各據一方的格局，台灣當局所轄之福建省主體即為金馬地區。

由於金門西距廈門不到10公里，而東距台灣本島則有277公里。因此台灣當局於2001年1月1日起實施金馬小三通，金馬地區開始展開與中國大陸小規模的通商、通航和通郵。

第二次國共內戰

抗日戰爭勝利后，福建各地中共組織一面發動和平民主運動，反對內戰；一面準備武裝在各地開展游擊戰爭。

1947年，中共閩浙贛區委領導人和武裝力量分赴福建各地開展游擊戰，並發動反抽丁、抗征糧和打穀倉等群眾運動。並於6月18日成立“中國人民解放軍閩粵贛邊總隊”（簡稱粵東支隊）。

1948年1月底　國民政府在廣東鬆口成立“閩粵邊區剿匪總指揮部”，以塗思宗為總指揮，對中共據點實行大規模的掃蕩。

1949年4月，解放軍在渡江戰役勝利后，乘勝南下，國軍兵敗如山倒。

1949年8月，“福建省政府”隨“中華民國國軍”由福州市遷駐金門縣。

1949年8月17日解放軍第三野戰軍第十兵團司令葉飛攻佔福建省省會福州，成立福建省人民政府和福建軍區。

1949年8月31日攻克晉江（今泉州）；9月16日攻克平潭，；9月25日攻克龍溪（今漳州）；10月10日渡海攻佔大嶝島和小嶝島；10月17日渡海攻佔廈門，並準備對廈門外海的金門島進行作戰。10月25日解放軍發動金門戰役，“國軍”擊退進攻的解放軍。“福建省政府”自10月由軍方全面接管，軍方全面接管沿海島嶼。實行軍管制度，停止金門、東山及馬祖的縣制，各設民政處管轄地方行政。

1950年3月首先成立“金門及馬祖兩軍管區行政公署”，代理原來的金門、連江、長樂、羅源、莆田等五縣實際轄區之政務。

1950年初，解放軍準備再進攻金門。解放軍進攻東山島。5月初，“國軍”從東山撤軍。

1950年6月朝鮮戰爭（國民黨稱韓戰）爆發后，以美國為首的聯合國軍擊敗北朝鮮，大舉越過三八線，進抵鴨綠江畔。中共中央軍委暫停攻台計劃，將主力部隊調往朝鮮，與美軍對峙。美國將台灣重新納入防禦體系，並派遣美國第七艦隊進入台灣海峽。國民黨軍取得大量美援，藉機加緊在沿海島嶼進行游擊戰。

1952年10月，國民黨金門防衛司令部司令官胡璉派軍於15日攻下南日島，隨後“國軍”悉數撤離該島。

1953年7月16日，朝鮮停戰協定簽署前，胡璉率“國軍”，對位於福建和廣東二省交界處的東山島突然發起了登陸進攻作戰。解放軍擊敗國民黨軍，取得東山島戰役的勝利。戰役后，蔣中正不再派出成編製的部隊“反攻大陸”，“反攻大陸”軍事作戰行動至此告終。

實施戰地政務

1955年1月20日，“福建省政府”在金門正式恢復建制，並於馬祖設立閩東北行政公署，管轄連江、長樂、羅源3縣之政務。7月，閩東北行政公署改製為福建省第一行政督察專員公署。

1956年7月16日，台灣當局令“省政府”移駐台灣省台北縣新店鎮辦公，並予以虛級化，負責研究有關“收復福建地區之重建計劃方案及對大陸福建地區廣播、閩僑聯繫、人才儲備與部屬戰地政務之一般行政工作”，同時撤銷“第一區行政督察專員公署”，並將莆田縣屬烏丘村暫歸金門縣管轄，羅源縣所屬東引島、西引島及長樂縣所屬東莒島、西莒島等島劃歸連江縣管轄。

1958年8月23日，解放軍炮擊金門、馬祖。後來中共放棄封鎖，宣布改采“單打雙不打”的方針，逐漸減少攻勢。期間除1965年間偶發的東引海戰、東山海戰和烏丘海戰之外，兩岸海空軍不斷有零星交手。

1979年中華人民共和國全國人民代表大會常務委員會發表《告台灣同胞書》，國防部長徐向前發表聲明，停止從1958年開始對大金門、小金門、大膽、二膽等島嶼炮擊，國共內戰大規模軍事衝突告一段落。

1987年7月台灣地區“解嚴”后，基於軍事考量，金馬地區仍實施戒嚴。同年8月21日3位金馬青年翁明志、王長明、陳振堅三人，到“福建省政府”靜坐，揭開了金馬反戒嚴運動的序幕。經歷長期的陳情與抗爭，台灣當局防務部門於1992年11月7日“金門、馬祖、東沙、南沙安全及輔導條例”公布施行，終止金馬地區戰地政務，解除了金馬實施長達43年的戒嚴令。

撤銷戰地政務以後

1992年11月7日，金馬地區戰地政務終止，實施地方自治，金門、連江縣回歸“民主憲政”。派任原防務部門指派的金門縣長陳水在、連江縣長曹常順為金門縣長、連江縣長，並將原來兩縣的諮詢代表會，改為臨時縣議會，代表會長、副會長改為議長、副議長，諮詢代表改為臨時縣議會議員。

1993年，金門縣長、連江縣長也陸續恢復民選。12月，舉行金門縣、連江縣第一屆民選縣長選舉。

1995年1月，舉行金門縣、連江縣第一屆民選縣議員選舉10月18日，成立“金門國家公園”，成為台灣地區第六座“國家”公園。

1996年1月15日，“省政府”奉台灣當局命令，從台灣省台北縣新店市（今新北市新店區）遷回金門辦公。

1998年，台灣當局全面進行省虛級化，“福建省政府”於法制上成為諮詢機關，不再具有地方政府的政治實權。

2004年2月3日，啟動金門-廈門航海線，開始“小三通”。

2007年5月21日，原任主席顏忠誠於5月20日隨蘇貞昌“內閣”總辭后，新任“行政院長”張俊雄停止任命“福建省主席及省府委員”，只由“省府”第一組組長楊誠璽暫時代理，向精省、“政府”架構精簡化的方向努力。11月21日，任命“行政院”秘書長陳景峻兼任“福建省政府主席”，由台灣當局官員兼任主席成現行模式，而“省府”之運作增設專任秘書長負責。

2012年7月7日，台置連江縣（馬祖鄉）當地舉行是否開放賭博（台灣稱博弈）的公民投票，結果為通過。

國共戰爭末期，福建省的大部份區域被中國人民解放軍解放，僅實際管轄福建沿海的部份島嶼。各行政督察區均因其專員公署潰散而消亡。民國38年（1949年）8月25日，福建省人民政府於福州市成立；9月，省人民政府公布福建省行政區劃通令，全省劃分為福州、廈門2地級市及8專區。次年3月，8個專區依次更名為閩侯、福安、南平、建甌（同年改稱建陽）、泉州（同年改稱晉江）、漳州（同年改稱龍溪）、永安、龍岩。

1949年11月，金門縣政府被撤銷，改依金門各駐軍轄區劃分為金東、金西、烈嶼三區，各設民政處管轄地方行政，三個民政處下共轄城廂、金城、金盤、滄湖、碧湖、金沙、烈嶼、古寧、瓊浦等九個區公所。

1950年3月，金東、金西、烈嶼三區民政處合併改設為“金門軍管區行政公署”，轄區除金門外，兼轄福建以南之島嶼。12月15日，馬祖列島成立“馬祖行政公署”，以島為單位，分設南竿、北竿、白肯、東涌、四礵、岱山、西津、浮鷹等八區，每區設區公所。

1951年，金門軍管區劃設金城、金寧、金湖、金沙、金山、烈嶼等六個區，各區由區公所治理。

1952年放棄馬祖行政公署的四礵、岱山、西津、浮鷹4區，餘下4區則依原縣恢復建制。

1953年2月，金門軍管區行政公署撤銷，恢復金門縣政府建制，並將原來的六區改製為鄉鎮，同時代管莆田縣的烏丘鄉（烏丘村）。3月，南竿、北竿兩區改為鄉，並以該2鄉恢復連江縣建制，8月改馬祖行政公署為“閩東北行政公署”，9月白肯區劃分為白肯鎮及東肯鄉，並恢復長樂縣建制，由閩東北行政公署就近督導連江、長樂、羅源3縣之政務。

1954年3月，改東涌區為鄉建制，並於其上恢復羅源縣建制。

1955年1月20日，“福建省政府”於金門正式恢復建制。7月，閩東北行政公署改製為“福建省第一行政督察專員公署”。

1956年6月，決定在福建省金馬地區實施戰地政務，由金門、馬祖兩地“防衛司令部”下設“政務委員會”負責地方行政，7月16日，“金門防衛司令部政務委員會”及“馬祖地區防衛部政務委員會”成立，實施軍政一元化體系，原有的各縣政府權力虛化。撤銷福建省第一區行政督察專員公署，並將莆田縣屬烏丘村暫歸金門縣管轄，羅源縣所屬東引島、西引島及長樂縣所屬東莒、西莒等島劃歸連江縣管轄。

1959年，金門縣增設金瓊鄉，金湖鄉改制金湖鎮。

1965年，金門縣撤置金山鄉及金瓊鄉。

1969年1月，金門防衛司令部政務委員會改名為“金門戰地政務委員會”，直屬台當局防務部門，並將部份業務移交金門縣政府掌理，軍方逐漸淡出地方行政體系。

1971年，西犬、東犬改名為西莒、東莒，併合並為莒光鄉。

1992年11月7日，金馬地區終止戰地政務，“金門縣政府“及“連江縣政府”恢復實際治理權。

國共戰爭以前，其省域與清代及今日的福建省相似。民國36年（1947年）全省土地面積為120114平方公里。光澤縣曾於民國23年（1934年）6月劃歸江西省管轄，民國36年（1947年）6月復來屬。東濱台灣海峽與台灣省相望，北鄰浙江省，西界江西省，南接廣東省。

自1949年以後，福建省實際管轄範圍僅包含馬祖列島（原分屬羅源縣、連江縣及長樂縣，現皆由連江縣管轄）、金門群島（金門縣）及烏丘嶼（莆田縣，現由金門縣代管），土地面積僅180.4560平方公里。

金門縣

金門島-歐亞水獺（列入瀕臨絕種動物名單）、亞洲小爪水獺（零星發現過腳印）、鱟，並有紀錄多種鳥類，如戴勝、黑面琵鷺、叉尾太陽鳥等。

烈嶼-歐亞水獺

連江縣（馬祖鄉）

馬祖列島-黑嘴端鳳頭燕鷗、白眉燕鷗、紅燕鷗、蒼燕鷗、鳳頭燕鷗、黑尾鷗、岩鷺、插尾雨燕

以下依據中華民國實業部《中國經濟年鑒》（1934年出版）、內政部統計司編《民國十七年各省市戶口調查統計報告》（1931年出版）、主計處統計局編《中華民國統計提要》（1940年出版）、中華民國年鑒社編《“中華民國”年鑒》（1952年出版，頁19-21）所提供的人口數據：

隨國民政府來台人數，據台灣當局“內政部戶政司”於1990年普查外省籍人口按本省籍分的資料，原福建省籍在台人數為41萬4163人，占外省籍269萬4917人口當中的15.37%，為外省籍中比例最高；其中福建本部為36萬4507人，占原福建省籍的88.01%，金馬地區為4萬9656人，佔11.99%。

台灣當局控制的福建省現有管轄範圍境內的居民幾乎全為漢族，分為金門島與烈嶼的閩南人、連江縣的閩東人（又稱福州人）以及烏丘雙島的莆仙人三種。人口以閩南人佔為多數，超過八萬人，而閩東人則有約一萬人，居於劣勢的莆仙人僅約500人。

除了國語外，閩南人則使用與台灣本島相同之閩南話，惟某些細節仍有小差異，但可以相通。閩東人則使用閩東話，當地又稱平話或是直接稱馬祖話、福州話。人數最少的莆仙人則使用莆仙話，當地稱為烏丘話，並融入當地戰地文化。

目前惟烏丘並無學校，所以並無鄉土語言教學，處境堪憂。

台灣當局控制的福建省（金門縣、馬祖鄉）缺少高等教育。由於台灣當局對於中國大陸地區學籍之認可有限制，學生多赴台灣本島就讀大學，極少部份選擇至廈門求學。

另外，近來金門、連江二縣皆有意願在縣境設立大學，金門技術學院在2010年8月1日升格為金門大學，成為金馬地區第一所高等學府。金門縣期望在未來，將金門打造成大學島，並邀台灣島上20多所大學，前來設分校。除銘傳大學設有金門校區外，“國立”高雄大學亦於同年6月1日成立金門校區，目前只提供EMBA班。連江縣則希望設立一所新大學，目前有銘傳大學設立的碩士在職專班，及金門大學設立的馬祖分班。

金門大學

銘傳大學金門校區

高雄大學金門校區

台灣首府大學二技專班

金門高級中學

金門高級農工職業學校

馬祖高級中學

台灣行政機構衛生署金門醫院