醫改方案
國家發改委發布的政策
充分認識深化醫藥衛生體制改革的重要性、緊迫性和艱巨性健康是人全面發展的基礎。醫藥衛生事業關係千家萬戶幸福，是重大民生問題。深化醫藥衛生體制改革，加快醫藥衛生事業發展，適應人民群眾日益增長的醫藥衛生需求，不斷提高人民群眾健康素質，是貫徹落實科學發展觀、促進經濟和社會全面協調可持續發展的必然要求，是維護社會公平正義的重要舉措，是人民生活質量改善的重要標誌，是全面建設小康社會和構建社會主義和諧社會的一項重大任務。
新中國成立以來，特別是改革開放以來，我國醫藥衛生事業取得了顯著成就，覆蓋城鄉的醫藥衛生服務體系基本形成，疾病防治能力不斷增強，醫療保障覆蓋人口逐步擴大，衛生科技水平迅速提高，人民群眾健康水平明顯改善，居民主要健康指標處於發展中國家前列。尤其是抗擊“非典”取得重大勝利以來，各級政府加大投入，公共衛生、農村醫療衛生和城市社區衛生加快發展，新型農村合作醫療和城鎮居民基本醫療保險取得突破性進展，為深化醫藥衛生體制改革打下了良好基礎。同時，也應該看到，當前我國醫藥衛生事業發展水平與經濟社會協調發展要求和人民群眾健康需求不適應的矛盾還比較突出。城鄉和區域醫療衛生事業發展不平衡，資源配置不合理，公共衛生和農村、社區醫療衛生工作比較薄弱，醫療保障制度不健全，藥品生產流通秩序不規範，醫院管理體制和運行機制不完善，政府衛生投入不足，醫藥費用上漲過快，人民群眾反映比較強烈。
從現在到2020年，是我國全面建設小康社會的關鍵時期，醫藥衛生工作肩負著繁重的任務。隨著經濟的發展和人民生活水平的提高，群眾對改善醫藥衛生服務將會有更高的要求。工業化、城鎮化、人口老齡化、疾病譜變化和生態環境變化等，都給醫藥衛生工作帶來一系列新的嚴峻挑戰。深化醫藥衛生體制改革，是加快醫藥衛生事業發展的戰略選擇，是實現人民共享改革發展成果的重要途徑，是廣大人民群眾的迫切願望。
深化醫藥衛生體制改革是一項涉及面廣、難度大的社會系統工程。我國人口多，人均收入水平低，城鄉、區域差距大，長期處於社會主義初級階段的基本國情，決定了深化醫藥衛生體制改革是一項十分複雜艱巨的任務，是一個漸進的過程，需要在明確方向和框架的基礎上，經過長期艱苦努力和堅持不懈的探索，才能逐步建立符合我國國情的醫藥衛生體制。
深化醫藥衛生體制改革的指導思想、基本原則和總體目標
指導思想
深化醫藥衛生體制改革的指導思想是：以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，深入貫徹落實科學發展觀，從我國國情出發，借鑒國際有益經驗，著眼於實現人人享有基本醫療衛生服務的目標，著力解決人民群眾最關心、最直接、最現實的利益問題。堅持公共醫療衛生的公益性質，堅持預防為主、以農村為重點、中西醫並重的方針，實行政事分開、管辦分開、醫藥分開、營利性和非營利性分開，強化政府責任和投入，完善國民健康政策，健全制度體系，加強監督管理，創新體制機制，鼓勵社會參與，建設覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度，不斷提高全民健康水平，促進社會和諧。
基本原則
深化醫藥衛生體制改革應遵循以下基本原則：
堅持以人為本，把維護人民健康權益放在第一位。堅持醫藥衛生事業為人民健康服務的宗旨，以保障人民健康為中心，以人人享有基本醫療衛生服務為根本出發點和落腳點，從改革方案設計、衛生制度建立到服務體系建設都要遵循公益性的原則，著力解決群眾反映強烈的突出問題，努力實現全體人民病有所醫。
堅持立足國情，建立中國特色的醫藥衛生體制。堅持從我國的基本國情出發，實事求是地總結醫藥衛生事業改革發展的實踐經驗，準確把握醫藥衛生髮展規律和主要矛盾；堅持基本醫療衛生服務水平與國民經濟和社會發展相協調、與人民群眾的承受能力相適應；充分發揮中醫藥作用；堅持因地制宜、分類指導，發揮地方積極性，探索建立符合國情的基本醫療衛生制度。
堅持公平效率統一，政府主導與發揮市場機製作用相結合。堅持政府主導，強化政府在基本醫療衛生制度中的責任，加強政府在制度、規劃、籌資、服務、監管等方面的職責，維護公共醫療衛生的公益性，促進公平公正；同時，注重發揮市場機製作用，促進有序競爭機制的形成，提高醫療衛生運行效率和服務水平、質量，滿足人民群眾多層次、多樣化的醫療衛生需求。
堅持統籌兼顧，把完善制度體系與解決當前突出問題結合起來。從全局出發，兼顧供給方和需求方等各方利益，注重預防、治療、康復三者的結合，正確處理政府、衛生機構、醫藥企業、醫務人員和人民群眾之間的關係。既著眼長遠，創新體制機制，又立足當前，著力解決醫藥衛生中存在的突出問題；既注重整體設計，明確總體改革方向目標和基本框架，又突出重點，分步實施，積極穩妥地推進改革。
深化醫藥衛生體制改革的總體目標是:建立覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度，為群眾提供安全、有效、方便、價廉的醫療衛生服務。
到2020年，覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度基本建立。普遍建立比較完善的公共衛生服務體系和醫療服務體系，比較健全的醫療保障體系，比較規範的藥品供應保障體系，比較科學的醫療衛生機構管理體制和運行機制，形成多元辦醫格局，人人享有基本醫療衛生服務，基本適應人民群眾多層次的醫療衛生需求，人民群眾健康水平進一步提高。
完善醫藥衛生四大體系，建立覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度。建立覆蓋城鄉居民的公共衛生服務體系、醫療服務體系、醫療保障體系、藥品供應保障體系四位一體的基本醫療衛生制度，四大體系相輔相成，配套建設，協調發展。
公共衛生服務體系
建立健全疾病預防控制、健康教育、婦幼保健、精神衛生、應急救治、采供血、衛生監督和計劃生育等專業公共衛生服務網路，並完善以基層醫療衛生服務網路為基礎的醫療服務體系的公共衛生服務功能，建立分工明確、信息互通、資源共享、協調互動的公共衛生服務體系，提高公共衛生服務能力和突發公共衛生事件應急處置能力，促進城鄉居民逐步享有均等化的基本公共衛生服務。
確定公共衛生服務範圍。明確國家公共衛生服務項目，逐步增加服務內容，細化服務和考核標準。鼓勵地方政府根據當地經濟水平和突出的公共衛生問題，在中央規定服務項目的基礎上增加公共衛生服務內容。
完善公共衛生服務體系。進一步明確公共衛生服務體系的職能、目標和任務，優化人員和設備配置，探索整合公共衛生服務資源的有效形式。完善重大疾病防控體系和突發公共衛生事件應急機制，加強對嚴重威脅人民健康的傳染病、地方病、職業病和慢性病等疾病的預防控制和監測。加強城鄉急救體系建設。
加強健康促進與教育。醫療衛生機構及機關、學校、社區、企業等要大力開展健康教育，倡導健康文明的生活方式，利用廣播、電視、網路、報刊雜誌等媒體，加強健康、醫藥衛生知識的傳播，促進公眾合理營養，提高廣大人民群眾的健康意識和自我保健能力。
加強衛生監督服務。大力促進環境衛生、食品衛生、職業衛生、學校衛生和農民工衛生工作。
醫療服務體系
堅持非營利性醫療機構為主體、營利性醫療機構為補充，公立醫療機構為主導、非公立醫療機構共同發展的辦醫原則，建設結構合理、分工明確、防治結合、技術適宜、運轉有序，包括覆蓋城鄉的基層醫療衛生服務網路和各類醫院在內的醫療服務體系。
大力發展農村醫療衛生服務體系。加快建立健全以縣級醫院為龍頭、鄉鎮衛生院為骨幹、村衛生室為基礎的農村三級醫療衛生服務網路。縣級醫院作為縣域內的醫療衛生中心，主要負責以住院為主的基本醫療服務及危重急症病人的搶救，並承擔對鄉村衛生機構的業務技術指導和鄉村衛生人員的進修培訓；鄉鎮衛生院負責提供公共衛生服務和常見病、多發病的診療等綜合服務，並承擔對村衛生室的業務管理和技術指導等工作；村衛生室承擔行政村的公共衛生服務及一般疾病的診治等工作。有條件的農村可以實行鄉村一體化管理。加快實施農村衛生服務體系建設與發展規劃，積極推進農村醫療衛生基礎設施和能力建設，政府重點辦好縣級醫院並在每個鄉鎮辦好一所衛生院，採取多種形式支持村衛生室建設，大力改善農村醫療衛生條件，提高醫療衛生服務質量。
完善以社區衛生服務為基礎的新型城市醫療衛生服務體系。大力發展社區衛生服務，加快建設以社區衛生服務中心為主體的城市社區衛生服務網路，完善社區衛生服務功能，以維護社區居民健康為中心，提供疾病預防控制等公共衛生服務和一般常見病、多發病、慢性病的初級診療服務。轉變社區衛生服務模式，堅持主動服務、上門服務，逐步承擔起居民健康“守門人”的職責。
健全各類醫院的功能和職責。優化醫院布局和結構，充分發揮城市醫院在急危重症和疑難病症的診療、醫學教育和科研、指導和培訓基層衛生人員等方面的骨幹作用。有條件的大醫院按照區域衛生規劃要求，可以通過託管、重組等方式促進醫療資源合理流動。
建立城市醫院與社區衛生服務機構的分工協作機制。城市醫院通過技術支持、人員培訓等方式，帶動社區衛生健康持續發展。同時，採取改善服務能力、降低收費標準、提高報銷比例等綜合措施，引導一般診療下沉到基層，逐步實現社區首診、分級醫療和雙向轉診。整合城市衛生資源，充分利用城市現有一、二級醫院及國有企事業所屬醫療機構等基層醫療資源，發展和完善社區衛生服務網路。
充分發揮包括民族醫藥在內的中醫藥在疾病預防控制、應對突發公共衛生事件、醫療服務中的作用。加強中醫臨床研究基地和中醫院建設，組織開展中醫藥防治疑難疾病的聯合攻關，在醫療衛生機構中大力推廣中醫藥適宜技術。創造良好的政策環境，扶持中醫藥發展，促進中醫藥繼承和創新。
建立城市醫院對口支援農村醫療衛生工作的制度。發達地區要加強對口支援貧困地區和少數民族地區發展醫療衛生事業。城市大醫院要與貧困地區和少數民族地區的縣級醫院建立長期穩定的對口支援和合作制度，採取臨床服務、人員培訓、技術指導、設備支援等方式，幫助其提高醫療水平和服務能力。
醫療保障體系
加快建立和完善以基本醫療保障為主體，其他多種形式補充醫療保險和商業健康保險為補充，覆蓋城鄉居民的多層次醫療保障體系。
建立覆蓋城鄉居民的基本醫療保障體系。城鎮職工基本醫療保險、城鎮居民基本醫療保險、新型農村合作醫療和城鄉醫療救助共同組成基本醫療保障體系，分別覆蓋城鎮就業人口、城鎮非就業人口、農村人口和城鄉困難人群。堅持廣覆蓋、保基本、可持續的原則，從重點保障大病起步，逐步向門診小病延伸，提高保障水平。建立國家、單位、家庭和個人責任明確、分擔合理的多渠道籌資機制，實現社會互助共濟。隨著經濟社會發展，逐步提高籌資水平和統籌層次，縮小保障水平差距，最終實現制度框架的基本統一。進一步完善城鎮職工基本醫療保險制度，加快覆蓋就業人口，重點解決國有關閉破產企業、困難企業等職工和退休人員以及混合所有制、非公有制經濟組織從業人員和靈活就業人員的醫療保險問題；加快推進城鎮居民基本醫療保險試點，到2009年全面推開，重視解決老人和兒童的基本醫療保險問題；全面實施新型農村合作醫療制度，逐步提高政府補助水平，適當增加農民繳費，提高保障能力。完善城鄉醫療救助制度。對困難人群參保及其難以負擔的醫療費用提供補助，築牢醫療保障底線。有條件的地區要採取多種方式積極探索建立城鄉一體化的基本醫療保障管理體系。
做好城鎮職工基本醫療保險制度、城鎮居民基本醫療保險制度、新型農村合作醫療制度和城鄉醫療救助制度之間的銜接，妥善解決農民工基本醫療保險問題。簽訂勞動合同並與企業建立穩定勞動關係的農民工，要按照國家規定明確用人單位繳費責任，將其納入城鎮職工基本醫療保險制度；其他農民工根據實際情況，參加戶籍所在地新型農村合作醫療或務工所在地城鎮居民基本醫療保險。積極做好農民工醫保關係接續、異地就醫和費用結算服務等政策銜接。
積極發展商業健康保險。鼓勵商業保險機構開發適應不同需要的健康保險產品，簡化理賠手續，方便群眾，滿足多樣化的健康需求。鼓勵企業和個人通過參加商業保險及多種形式的補充保險解決基本醫療保障之外的需求。繼續探索商業保險機構參與新型農村合作醫療等經辦管理的方式。
藥品供應保障體系
以建立國家基本藥物制度為基礎，以培育具有國際競爭力的醫藥產業、提高藥品生產流通企業集中度、規範藥品生產流通秩序、完善藥品價格形成機制、加強政府監管為主要內容，建設規範化、集約化的藥品供應保障體系，不斷完善執業藥師制度，保障人民群眾安全用藥。
建立國家基本藥物制度。中央政府統一制定和發布國家基本藥物目錄，按照防治必需、安全有效、價格合理、使用方便、中西藥並重的原則，結合我國用藥特點，參照國際經驗，合理確定我國基本藥物品種和數量。建立基本藥物的生產供應體系，在政府宏觀調控下充分發揮市場機制的作用，基本藥物由國家實行招標定點生產或集中採購，直接配送，減少中間環節，在合理確定生產環節利潤水平的基礎上統一制定零售價，確保基本藥物的生產供應，保障群眾基本用藥。規範基本藥物使用，制訂基本藥物使用規範和臨床應用指南。城市社區衛生服務中心（站）、鄉鎮衛生院、村衛生室等基層醫療衛生機構應全部使用基本藥物，其他各類醫療機構也要將基本藥物作為首選藥物並確定使用比例。基本藥物全部納入基本醫療保障體系藥物報銷目錄，報銷比例明顯高於非基本藥物。
規範藥品生產流通。完善醫藥產業發展政策和行業發展規劃，嚴格市場准入，嚴格藥品註冊審批，大力規範和整頓生產流通秩序，推動醫藥產業優化升級和技術進步，發展藥品現代物流和連鎖經營，促進藥品生產、流通企業的整合。建立覆蓋面廣、體系健全、便民惠農的農村藥品供應網和監督網。支持用量小的特殊用藥、急救用藥生產。完善藥品儲備制度。規範藥品採購，堅決治理醫藥購銷中的商業賄賂。加強藥品不良反應監測，建立藥品安全預警機制和應急處置機制。完善體制機制，保障醫藥衛生體系有效規範運轉完善醫藥衛生的管理、運行、投入、價格、監管體制機制，加強科技與人才、信息、法制建設，保障醫藥衛生體系有效規範運轉。
管理體制
按照政事分開、管辦分開、屬地化和全行業管理的原則，合理確定不同層級政府之間、政府與醫藥衛生機構之間的職責範圍，形成職能明確、定位清晰、綜合協調、權責統一的管理體制。
實施屬地化和全行業管理。所有醫療衛生機構，不論所有制、投資主體、隸屬關係和經營性質，均由所在地衛生行政部門實行統一規劃、統一準入、統一監管。中央、省級可以設置少量承擔醫學科研、教學功能的醫學中心或區域醫療中心、承擔全國或區域性疑難病症診治的專科醫院等醫療機構；縣（市、區）主要負責舉辦縣級醫院、鄉村衛生和社區衛生機構；其餘公立醫院由設區的市負責舉辦。
強化區域衛生規劃。省級人民政府制定衛生資源配置標準，組織編製區域衛生規劃和醫療機構設置規劃，明確醫療機構的數量、規模、布局和功能。科學制定鄉鎮衛生院（村衛生室）、社區衛生服務中心（站）等基層衛生機構和各級醫院建設和設備配置標準。充分利用和優化配置現有醫療衛生資源，調整優化結構和布局，對不符合規劃要求的醫療機構要逐步進行整合，嚴格控制大型醫療設備配置，鼓勵共建共享，提高醫療衛生資源利用效率。新增衛生資源必須符合區域衛生規劃，重點投向農村和社區衛生等薄弱環節。加強區域衛生規劃與城市發展規劃、土地利用規劃等的銜接。建立區域衛生規劃和資源配置監督評價機制。
推進公立醫院管理體制改革。從有利於強化公立醫院公益性和政府有效監管出發，積極探索政事分開、管辦分開的多種實現形式。進一步轉變政府職能，衛生行政部門主要承擔衛生髮展規劃、資格准入、規範標準、服務監管等行業管理職能，其他有關部門按照各自職能進行管理和提供服務。落實公立醫院獨立法人地位。
進一步完善基本醫療保險管理體制。中央統一制定基本醫療保險制度框架和政策，地方政府負責組織實施管理，創造條件逐步提高統籌層次。有效整合基本醫療保險經辦資源，逐步實現城鄉基本醫療保險行政管理的統一。
以維護公立醫療衛生機構公益性質為核心，逐步建立規範、科學、高效、有序的醫藥衛生機構運行機制。
轉變基層醫療衛生機構運行機制。政府舉辦的城市社區衛生服務中心（站）和鄉鎮衛生院等基層醫療衛生機構，要嚴格界定服務功能，明確規定使用適宜技術、適宜人才、適宜設備和基本藥物，為廣大群眾提供低成本服務，維護公益性質。要嚴格核定人員編製，實行人員聘用制，建立能進能出和激勵有效的人力資源管理制度。要明確收支範圍和標準，實行核定任務、核定收支、績效考核補助的財務管理辦法，並探索實行收支兩條線、公共衛生和醫療保障經費的總額預付等多種行之有效的管理辦法，嚴格收支預算管理，提高資金使用效益。要改革藥品加成政策，實行藥品零差率銷售。加強和完善內部管理，建立以服務質量為核心、以崗位責任與績效為基礎的考核和激勵制度，形成保障公平效率的長效機制。
建立規範的公立醫院運行機制。公立醫院要遵循公益性質和社會效益原則，堅持以病人為中心，優化服務流程，規範用藥檢查和醫療行為，深化運行機制改革。建立和完善醫院法人治理結構，明確所有者和管理者的責權，形成決策、執行、監督相互制衡，有責任、有激勵、有約束、有競爭、有活力的機制。實行醫藥收支分開管理，探索有效方式逐步改革以葯補醫機制。通過實行藥品購銷差別加價、設立葯事服務費等多種方式逐步改革或取消藥品加成政策，同時採取適當調整醫療服務價格、增加政府投入、改革支付方式等措施完善公立醫院補償機制。進一步完善財務、會計管理制度，嚴格預算管理，加強財務監管和運行監督。地方可結合本地實際，對有條件的醫院開展“核定收支、以收抵支、超收上繳、差額補助、獎懲分明”等多種管理辦法的試點。改革人事制度，完善分配激勵機制，推行聘用制度和崗位管理制度，嚴格工資總額管理，實行以服務質量及崗位工作量為主的綜合績效考核和崗位績效工資制度，有效調動醫務人員的積極性。
投入機制
明確政府、社會與個人的投入責任，確立政府在提供公共衛生和基本醫療服務中的主導地位。公共衛生服務主要通過政府籌資，向城鄉居民均等化提供。基本醫療服務由政府、社會和個人三方合理分擔費用。特需醫療服務由個人直接付費或通過商業健康保險支付。
建立和完善政府衛生投入機制。中央政府和地方政府都要增加對衛生的投入，併兼顧供給方和需求方。逐步提高政府衛生投入占衛生總費用的比重，使居民個人基本醫療衛生費用負擔明顯減輕；政府衛生投入增長幅度要高於經常性財政支出的增長幅度，使政府衛生投入占經常性財政支出的比重逐步提高。新增政府衛生投入重點用於支持公共衛生、農村衛生、城市社區衛生和基本醫療保障。
按照分級負擔的原則合理劃分中央和地方各級政府衛生投入責任。地方政府承擔主要責任，中央政府主要對國家免疫規劃、跨地區的重大傳染疾病預防控制等公共衛生、城鄉居民的基本醫療保障以及有關公立醫療衛生機構建設等給予補助。加大中央、省級財政對困難地區的專項轉移支付力度。
完善政府對公共衛生的投入機制。專業公共衛生服務機構的人員經費、發展建設和業務經費由政府全額安排，按照規定取得的服務收入上繳財政專戶或納入預算管理。逐步提高人均公共衛生經費，健全公共衛生服務經費保障機制。
完善政府對城鄉基層醫療衛生機構的投入機制。政府負責其舉辦的鄉鎮衛生院、城市社區衛生服務中心（站）按國家規定核定的基本建設、設備購置、人員經費和其承擔公共衛生服務的業務經費，使其正常運行。對包括社會力量舉辦的所有鄉鎮衛生院和城市社區衛生服務機構，各地都可採取購買服務等方式核定政府補助。支持村衛生室建設，對鄉村醫生承擔的公共衛生服務等任務給予合理補助。
落實公立醫院政府補助政策。逐步加大政府投入，主要用於基本建設和設備購置，扶持重點學科發展，符合國家規定的離退休人員費用和補貼政策性虧損等，對承擔的公共衛生服務等任務給予專項補助，形成規範合理的公立醫院政府投入機制。對中醫院、傳染病院、精神病院、婦幼保健院和兒童醫院等在投入政策上予以傾斜。嚴格控制公立醫院建設規模、標準和貸款行為。
完善政府對基本醫療保障的投入機制。政府提供必要的資金支持新型農村合作醫療、城鎮居民基本醫療保險、城鎮職工基本醫療保險和城鄉醫療救助制度的建立和完善。保證相關經辦機構正常經費。
鼓勵和引導社會資本發展醫療衛生事業。積極促進非公醫療衛生機構發展，形成投資主體多元化、投資方式多樣化的辦醫體制。抓緊制訂和完善有關政策法規，規範社會辦醫療機構包括外資辦醫療機構的准入條件，完善公平公正的行業管理政策。鼓勵社會資金依法興辦非營利性醫療機構。國家制定公立醫院改制的指導性意見，積極引導社會資金以多種方式參與包括國有企業所辦醫院在內的部分公立醫院改制重組。穩步推進公立醫院改制的試點，適度降低公立醫療機構比重，形成公立醫院與非公立醫院相互促進、共同發展的格局。支持有資質人員依法開業，方便群眾就醫。完善醫療機構分類管理政策和稅收優惠政策。依法加強對社會辦醫的監管。
大力發展慈善事業。制定相關優惠政策，鼓勵社會力量興辦慈善醫療機構，或向醫療救助、醫療機構等慈善捐贈。
完善政府調控與市場調節相結合、客觀反映市場供求情況和生產服務成本變化的醫療服務和藥品價格形成機制。
規範醫療服務價格管理。對非營利性醫療機構提供的基本醫療服務，實行政府指導價，其餘由醫療機構自主定價。中央政府負責制定醫療服務價格政策及項目、定價原則及方法；省或市級價格主管部門會同衛生、勞動保障部門核定基本醫療服務指導價格。基本醫療服務價格按照扣除財政補助的服務成本制定，體現醫療服務成本和技術勞務價值。不同級別的醫療機構和醫生提供的服務，實行分級定價。規範公立醫療機構收費項目和標準，研究探索按病種等收費方式改革。建立醫用檢查治療設備儀器價格監測、服務成本監審和服務價格定期調整制度。
改革藥品價格形成機制。合理調整政府定價範圍，改進藥品定價方法，利用價格槓桿鼓勵企業自主創新，促進國家基本藥物的生產和使用。對新葯和專利藥品逐步實行上市前藥物經濟性評價制度。對仿製藥品實行後上市價格從低定價制度，抑制低水平重複建設。推行在藥品外包裝上標示價格制度。嚴格控制藥品流通環節差價率。對醫院銷售藥品開展差別加價、收取葯事服務費等試點，引導醫院合理用藥。加強醫用耗材及植（介）入類醫療器械流通和使用環節價格的控制和管理。健全醫藥價格監測體系，規範企業自主定價行為。
積極探索建立醫療保險經辦機構與醫療機構、藥品供應商的談判機制，發揮醫療保障對醫療服務和藥品費用的制約作用。
監管體制
完善監管網路，強化監管職責，創新監管手段，提高依法監管能力，逐步建立政府為主體、社會多方參與的監管體制。
強化醫療衛生監管。健全衛生監督執法體系，加強衛生監督機構能力建設。加強醫療衛生服務行為和質量監管，完善醫療衛生服務標準和質量評價體系，規範管理制度和工作流程，加快制定統一的疾病診療規範，健全醫療衛生服務質量監測網路。加強醫療衛生機構的准入和運行監管。加強對生活飲用水、職業衛生、食品安全等社會公共衛生的監管。依法嚴厲打擊各種危害人民群眾身體健康和生命安全的違法行為。
完善醫療保障監管。加強對醫療保險經辦、基金管理和使用等環節的監管，建立醫療保險基金有效使用和風險防範機制。強化醫療保障對醫療服務的監控作用，完善支付制度，積極探索實行按人頭付費、按病種付費、總額預付等方式，建立激勵與懲戒並重的有效約束機制。加強商業健康保險監管，促進規範發展。
加強藥品監管。強化政府監管責任，完善體系建設，嚴格藥品生產、流通、價格、廣告和使用的監管。落實藥品生產管理規範，加強對高風險品種生產的監管。嚴格實施藥品經營管理規範，探索建立藥品經營許可分類、分級的管理模式，加大重點品種的監督抽驗力度。加強政府對藥品價格的監管，有效抑制虛高定價。規範藥品臨床使用，發揮執業藥師指導合理用藥與藥品質量管理方面的作用。
建立信息公開制度。鼓勵行業協會等社會組織、個人對政府部門、醫藥機構和相關體系的運行績效進行獨立評價和監督。加強行業自律。建立可持續發展的醫藥衛生科技創新機制和人才保障機制立足衛生事業發展，服務人民群眾健康，逐步建立層次完整、結構合理、重點突出、可持續的科技創新機制和人才保障機制。
推進醫藥科技進步。把醫藥衛生科技創新作為國家科技發展的重點，以防病治病為中心，努力攻克醫藥科技難關，為人民群眾健康提供技術保障。遵循自主創新、重點跨越、協調發展、引領未來的方針，深化醫藥衛生科技體制和機構改革，整合優勢醫學科研資源，加快實施醫藥科技重大專項，加強對重大疾病防治技術和新葯研製關鍵技術等的研究，在醫學基礎和應用研究、高技術研究、中醫和中西醫結合研究等方面力求新的突破。針對人民群眾的醫療衛生需求，加強醫學科研，開發生產適合我國國情的醫療器械。廣泛開展國際衛生科技合作交流。大力推廣適宜技術，全面推進醫藥衛生科技進步。
加強醫藥衛生人才隊伍建設。制訂和實施人才隊伍建設規劃，重點加強公共衛生、農村衛生、城市社區衛生專業技術人員和護理人員的培養培訓。制定優惠政策，鼓勵優秀衛生人才到農村、城市社區和中西部地區服務。對長期在城鄉基層工作的衛生技術人員在職稱晉陞、業務培訓、待遇政策等方面給予適當傾斜。完善全科醫師任職資格制度，健全農村和城市社區衛生人員在崗培訓制度，鼓勵參加學歷教育，促進鄉村醫生執業規範化，儘快實現基層醫療衛生機構都有合格的全科醫生。加強高層次科研、醫療、衛生管理等人才隊伍建設。培育壯大中醫藥人才隊伍。穩步推動醫務人員的合理流動，促進不同醫療機構之間人才的縱向和橫向交流，研究探索註冊醫師多點執業。逐步規範醫院管理者的任職條件，逐步形成一支職業化、專業化的醫療機構管理隊伍。
調整高等醫學教育結構和規模。加強全科醫學教育。完善標準化、規範化的臨床醫學教育，提高醫學教育質量。加大醫學教育投入，大力發展面向農村的高等醫學本專科教育，採取定向免費培養等多種方式，為貧困地區農村培養實用的衛生人才，造就大批紮根農村、服務農民的合格醫生。
信息系統
以推進公共衛生、醫療、醫保、藥品、財務監管信息化建設為著力點，加快信息標準化和公共服務信息平台建設，逐步建立統一高效、資源整合、互聯互通、信息共享、透明公開、使用便捷、實時監管的醫藥衛生信息系統。
加快醫療衛生信息系統建設。完善以疾病控制網路為主體的公共衛生信息系統，提高預測預警和分析報告能力。以建立居民健康檔案為重點，構建鄉村和社區衛生信息網路平台。以醫院管理和電子病歷為重點，推進醫院信息化建設。利用網路信息技術，促進城市醫院與社區衛生服務機構的合作，積極發展面向農村及邊遠地區的遠程醫療。
建立和完善醫療保障信息系統。加快基金管理、費用結算與控制、醫療行為管理與監督、參保單位和個人管理服務等具有複合功能的醫療保障信息系統建設。加強城鎮職工、居民基本醫療保險和新型農村合作醫療信息系統建設，實現與醫療機構信息系統的對接，積極推廣“一卡通”等辦法，方便參保（合）人員就醫，增加醫療服務的透明度。
建立和完善國家、省、市三級藥品監管、藥品檢驗檢測、藥品不良反應監測信息網路，加強對藥品研製、生產、流通、使用全過程關鍵環節的監控。
法律制度
進一步加強醫藥衛生立法工作，逐步建立健全與基本醫療衛生制度相適應、比較完整的衛生法律制度。
完善衛生法律法規。加快推進基本醫療衛生立法工作，明確政府、社會和居民在促進健康方面的權利和義務，保障人人享有基本醫療衛生服務。建立健全衛生標準體系，做好相關法律法規的銜接與協調。加快中醫藥立法工作。
推進依法行政。嚴格執法，規範執法，切實提高各級政府運用法律手段發展和管理醫藥衛生事業的能力。加強醫藥衛生普法工作，提高全社會法律意識和法制觀念，努力創造有利於人民群眾身體健康的法制環境。著力抓好五方面重點工作，力爭近期取得明顯成效深化醫藥衛生體制改革要立足當前，從著力解決人民群眾反映強烈的“看病難、看病貴”問題入手，讓老百姓得到實惠，讓醫務人員受到鼓舞，讓監管人員易於掌握。到2010年，在全國初步建立基本醫療衛生制度框架。
保障制度建設
基本醫療保障制度全面覆蓋城鄉居民，城鎮職工基本醫療保險、城鎮居民基本醫療保險和新型農村合作醫療參保（合）率達到90%以上。促進各項基本醫療保障制度協調和銜接。完善醫療保障管理體制機制，逐步提高籌資和保障水平。進一步健全城鄉醫療救助制度，明顯減輕城鄉居民個人醫藥費用負擔。
基本藥物制度
建立比較完整的基本藥物遴選、生產供應、使用和醫療保險報銷制度等體系，保證群眾基本用藥的可及性、安全性和有效性。規範基本藥物的生產和配送，基層醫療衛生機構基本藥物直接配送覆蓋面力爭達到80%。合理確定基本藥物的價格，完善基本藥物的醫保報銷政策，提高合理用藥水平，減輕群眾基本用藥費用負擔。
服務體系
加快農村鄉鎮衛生院、村衛生室和城市社區衛生服務機構建設，實現基層醫療衛生服務網路的全面覆蓋，加強基層醫療衛生人才隊伍建設，特別是全科醫生培養培訓，著力提高基層醫療衛生機構服務水平和質量，農村居民小病不出鄉，城市居民享有便捷有效的社區衛生服務。轉變基層醫療衛生機構運行機制和服務模式，完善投入機制，逐步建立分級診療和雙向轉診制度，城鄉居民基本醫療衛生服務費用負擔減輕，利用基層醫療衛生服務量明顯增加。
服務均等化
健全城鄉公共衛生服務體系，逐步擴大國家公共衛生服務項目範圍，向城鄉居民提供疾病防控、計劃免疫、婦幼保健、健康教育等基本公共衛生服務。實施國家重大公共衛生專項，有效預防控制重大疾病。進一步提高突發重大公共衛生事件處置能力。逐步縮小城鄉居民基本公共衛生服務差距，提高全民健康水平。完善公共衛生服務經費保障機制，加強績效考核，提高服務效率和質量。
改革試點
探索建立比較規範的公立醫院管理體制和運行機制，採取有效方式改革以葯補醫機制，加大政府投入，規範收支管理，使藥品、檢查收入比重明顯下降。改進內部管理，優化服務流程，規範診療行為，明顯縮短病人等候時間，實現檢查結果互認。
切實加強領導
各級政府要充分認識深化醫藥衛生體制改革的重大意義，切實加強組織領導，把解決群眾看病就醫問題作為改善民生的重點擺上重要議事日程，落實政府的公共醫療衛生責任。國務院成立深化醫藥衛生體制改革領導小組，統籌組織實施深化醫藥衛生體制改革。國務院有關部門要認真履行職責，密切配合，形成合力。地方政府要按照本指導意見的要求，結合實際情況，因地制宜地制訂具體實施方案和有效措施，精心組織，有序推進，確保改革成果惠及全體人民群眾。
突出重點，分步實施
建立覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度是一項長期任務。國務院有關部門要按照本指導意見確定的基本方向和框架體系，抓緊制訂相關配套文件，進一步深化、細化和實化政策措施，並做好各項制度、政策之間的配套和銜接，協調推進各項改革。近幾年要重點抓好推進基本醫療保障制度建設、建立國家基本藥物制度、健全基層醫療衛生服務體系、促進基本公共衛生服務均等化和推進公立醫院改革試點等工作。
組織開展試點工作
醫藥衛生改革涉及面廣、情況複雜，對一些難點問題要先行試點，取得經驗后逐步推廣。近期要力爭在探索公立醫院管辦分開、改革以葯補醫、規範運行機制和衛生投入機制等方面取得突破。國務院深化醫藥衛生體制改革領導小組負責統籌協調、指導各地試點工作，在全國選擇部分地方或單位開展試點。中央負責制定試點原則和政策框架，地方負責制定具體試點實施方案並組織實施。鼓勵地方繼續探索創新，結合當地實際開展多種形式的試點。
做好輿論宣傳工作
深化醫藥衛生體制改革直接關係廣大群眾的切身利益，是一項重大的民生工程，需要社會各界和廣大群眾的理解、支持和參與。要堅持正確的輿論導向，加強對深化醫藥衛生體制改革的重大意義、指導思想、基本原則和主要政策的宣傳，總結推廣好的試點經驗，使這項惠及廣大人民群眾的重大改革深入人心，為深化改革營造良好的輿論環境。